Decoding the Multi-facets of Cellular Identity from Single-cell Data

Informations projet

DecodeSC

N° de convention de subvention: 101040660

DOI

10.3030/101040660

Date de signature de la CE 18 Mars 2022

Date de début 1 Octobre 2022

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 484 125,00

Contribution de l’UE

€ 1 484 125,00

Coordonné par

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (1)

Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (7)

Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates

Auteurs: Yueqi, Sheng; Boaz, Barak; Mor, Nitzan
Publié dans: Bioinformatics, 2023, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btad253

scPrisma infers, filters and enhances topological signals in single-cell data using spectral template matching

Auteurs: Jonathan Karin; Yonathan Bornfeld; Mor Nitzan
Publié dans: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01663-5

Mapping lineage-traced cells across time points with moslin

Auteurs: Marius Lange, Zoe Piran, Michal Klein, Bastiaan Spanjaard, Dominik Klein, Jan Philipp Junker, Fabian J. Theis, Mor Nitzan
Publié dans: Genome Biology, Numéro 25, 2024, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-024-03422-4

TACCO unifies annotation transfer and decomposition of cell identities for single-cell and spatial omics

Auteurs: Simon Mages; Noa Moriel; Inbal Avraham-Davidi; Evan Murray; Jan Watter; Fei Chen; Orit Rozenblatt-Rosen; Johanna Klughammer; Aviv Regev; Mor Nitzan
Publié dans: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01657-3

Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues

Auteurs: Miri Adler, Noa Moriel, Aleksandrina Goeva, Inbal Avraham-Davidi, Simon Mages, Taylor S. Adams, Naftali Kaminski, Evan Z. Macosko, Aviv Regev, Ruslan Medzhitov, Mor Nitzan
Publié dans: Cell Reports, Numéro 42, 2024, ISSN 2211-1247
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112412

Disentanglement of single-cell data with biolord

Auteurs: Zoe Piran; Niv Cohen; Yedid Hoshen; Mor Nitzan
Publié dans: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1546-1696
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-02079-x

Nature Communications

Auteurs: Zoe Piran; Mor Nitzan
Publié dans: Nature Communications, Vol 15, Iss 1, Pp 1-17 (2024), 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44757-7

Conference proceedings (2)

Let's do the time-warp-attend: Learning topological invariants of dynamical systems

Auteurs: Moriel, Noa; Ricci, Matthew; Nitzan, Mor
Publié dans: International Conference on Learning Representations (ICLR 2023), 2024
Éditeur: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2312.09234

Phase2vec: Dynamical systems embedding with a physics-informed convolutional network

Auteurs: Ricci, Matthew; Moriel, Noa; Piran, Zoe; Nitzan, Mor
Publié dans: International Conference on Learning Representations (ICLR), 2023
Éditeur: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2212.03857