Decoding the Multi-facets of Cellular Identity from Single-cell Data

Informazioni relative al progetto

DecodeSC

ID dell’accordo di sovvenzione: 101040660

DOI

10.3030/101040660

Data della firma CE 18 Marzo 2022

Data di avvio 1 Ottobre 2022

Data di completamento 30 Settembre 2027

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 484 125,00

Contributo UE

€ 1 484 125,00

Coordinato da

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Documents, reports (1)

Data Management Plan

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (7)

Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates

Autori: Yueqi, Sheng; Boaz, Barak; Mor, Nitzan
Pubblicato in: Bioinformatics, 2023, ISSN 1367-4811
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btad253

scPrisma infers, filters and enhances topological signals in single-cell data using spectral template matching

Autori: Jonathan Karin; Yonathan Bornfeld; Mor Nitzan
Pubblicato in: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01663-5

Mapping lineage-traced cells across time points with moslin

Autori: Marius Lange, Zoe Piran, Michal Klein, Bastiaan Spanjaard, Dominik Klein, Jan Philipp Junker, Fabian J. Theis, Mor Nitzan
Pubblicato in: Genome Biology, Numero 25, 2024, ISSN 1474-760X
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-024-03422-4

TACCO unifies annotation transfer and decomposition of cell identities for single-cell and spatial omics

Autori: Simon Mages; Noa Moriel; Inbal Avraham-Davidi; Evan Murray; Jan Watter; Fei Chen; Orit Rozenblatt-Rosen; Johanna Klughammer; Aviv Regev; Mor Nitzan
Pubblicato in: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01657-3

Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues

Autori: Miri Adler, Noa Moriel, Aleksandrina Goeva, Inbal Avraham-Davidi, Simon Mages, Taylor S. Adams, Naftali Kaminski, Evan Z. Macosko, Aviv Regev, Ruslan Medzhitov, Mor Nitzan
Pubblicato in: Cell Reports, Numero 42, 2024, ISSN 2211-1247
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112412

Disentanglement of single-cell data with biolord

Autori: Zoe Piran; Niv Cohen; Yedid Hoshen; Mor Nitzan
Pubblicato in: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1546-1696
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-02079-x

Nature Communications

Autori: Zoe Piran; Mor Nitzan
Pubblicato in: Nature Communications, Vol 15, Iss 1, Pp 1-17 (2024), 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44757-7

Conference proceedings (2)

Let's do the time-warp-attend: Learning topological invariants of dynamical systems

Autori: Moriel, Noa; Ricci, Matthew; Nitzan, Mor
Pubblicato in: International Conference on Learning Representations (ICLR 2023), 2024
Editore: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2312.09234

Phase2vec: Dynamical systems embedding with a physics-informed convolutional network

Autori: Ricci, Matthew; Moriel, Noa; Piran, Zoe; Nitzan, Mor
Pubblicato in: International Conference on Learning Representations (ICLR), 2023
Editore: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2212.03857