Decoding the Multi-facets of Cellular Identity from Single-cell Data

Projektinformationen

DecodeSC

ID Finanzhilfevereinbarung: 101040660

DOI

10.3030/101040660

EK-Unterschriftsdatum 18 März 2022

Startdatum 1 Oktober 2022

Enddatum 30 September 2027

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 484 125,00

EU-Beitrag

€ 1 484 125,00

Koordiniert durch

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

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Leistungen

Documents, reports (1)

Data Management Plan

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (7)

Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates

Autoren: Yueqi, Sheng; Boaz, Barak; Mor, Nitzan
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2023, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btad253

scPrisma infers, filters and enhances topological signals in single-cell data using spectral template matching

Autoren: Jonathan Karin; Yonathan Bornfeld; Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01663-5

Mapping lineage-traced cells across time points with moslin

Autoren: Marius Lange, Zoe Piran, Michal Klein, Bastiaan Spanjaard, Dominik Klein, Jan Philipp Junker, Fabian J. Theis, Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 25, 2024, ISSN 1474-760X
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-024-03422-4

TACCO unifies annotation transfer and decomposition of cell identities for single-cell and spatial omics

Autoren: Simon Mages; Noa Moriel; Inbal Avraham-Davidi; Evan Murray; Jan Watter; Fei Chen; Orit Rozenblatt-Rosen; Johanna Klughammer; Aviv Regev; Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2023, ISSN 1546-1696
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01657-3

Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues

Autoren: Miri Adler, Noa Moriel, Aleksandrina Goeva, Inbal Avraham-Davidi, Simon Mages, Taylor S. Adams, Naftali Kaminski, Evan Z. Macosko, Aviv Regev, Ruslan Medzhitov, Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 42, 2024, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112412

Disentanglement of single-cell data with biolord

Autoren: Zoe Piran; Niv Cohen; Yedid Hoshen; Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1546-1696
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-02079-x

Nature Communications

Autoren: Zoe Piran; Mor Nitzan
Veröffentlicht in: Nature Communications, Vol 15, Iss 1, Pp 1-17 (2024), 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44757-7

Conference proceedings (2)

Let's do the time-warp-attend: Learning topological invariants of dynamical systems

Autoren: Moriel, Noa; Ricci, Matthew; Nitzan, Mor
Veröffentlicht in: International Conference on Learning Representations (ICLR 2023), 2024
Herausgeber: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2312.09234

Phase2vec: Dynamical systems embedding with a physics-informed convolutional network

Autoren: Ricci, Matthew; Moriel, Noa; Piran, Zoe; Nitzan, Mor
Veröffentlicht in: International Conference on Learning Representations (ICLR), 2023
Herausgeber: International Conference on Learning Representations (ICLR)
DOI: 10.48550/arxiv.2212.03857