Objetivo
Proteins are molecular machines that drive all major functions in cells. Controlling the activity of proteins in real time via light or chemicals is a central goal in synthetic biology. The design of switchable proteins, in particular single-chain, allosteric variants, however, is a challenging engineering problem thus-far mostly addressed by trial-and-error.
DaVinci-Switches takes a radically new, data-driven perspective to fundamentally advance our understanding of protein allostery and accelerate and eventually rationalize the engineering of switchable proteins by interfacing synthetic biology with machine learning. We will establish a 'design by directed evolution' approach to create switchable proteins through receptor and effector fusion followed by phage-assisted in vivo directed evolution using synthetic gene circuits for selection. We will apply this novel pipeline to a diverse set of effector proteins and monitor the evolutionary process by next-generation sequencing (Objective 1). In parallel, we will perform an in-depth computational analysis of domain insertions within the natural protein repertoire. The combined, rich datasets will be used to train machine learning models to infer sequence patterns predictive of domain insertion tolerance and allosteric coupling between receptor-effector pairs (Objective 2). Finally, we will employ this unique model to design light- and drug-inducible variants of the Yamanaka cell reprogramming factors. These will provide the foundation of an Adeno-associated virus-based platform for cyclic, partial in vivo reprogramming of somatic cells with enormous potential for regenerative medicine, which will be evaluated in a murine model of drug-induced liver injury (Objective 3). DaVinci-Switches harnesses our key competences in protein engineering, synthetic biology and computation to reveal fundamental principles of allostery and enable transformative advances in the design of switchable proteins for research and medicine.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2021-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.