Decoding the path to cellular variation within pathogen populations

Informazioni relative al progetto

switchDecoding

ID dell’accordo di sovvenzione: 101044320

DOI

10.3030/101044320

Data della firma CE 19 Aprile 2022

Data di avvio 1 Aprile 2023

Data di completamento 31 Marzo 2028

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 999 825,00

Contributo UE

€ 1 999 825,00

Coordinato da

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (6)

Nature Communications

Autori: Claudia Rabuffo; Markus R. Schmidt; Prateek Yadav; Pin Tong; Roberta Carloni; Anna Barcons-Simon; Raúl O. Cosentino; Stefan Krebs; Keith R. Matthews; Robin C. Allshire; T. Nicolai Siegel
Pubblicato in: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41467-024-55285-9

Decoding the impact of nuclear organization on antigenic variation in parasites

Autori: Anna Barcons-Simon; Mark Carrington; T. Nicolai Siegel
Pubblicato in: Nature Microbiology, 2023, ISSN 2058-5276
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/S41564-023-01424-9

Tissue spaces are reservoirs of antigenic diversity for Trypanosoma brucei

Autori: Alexander K. Beaver; Zhibek Keneskhanova; Raúl O. Cosentino; Brian L. Weiss; Erick O. Awuoche; Gretchen M. Smallenberger; Gracyn Y. Buenconsejo; Nathan P. Crilly; Jaclyn E. Smith; Jill M. C. Hakim; Bailin Zhang; Bryce Bobb; Filipa Rijo-Ferreira; Luisa M. Figueiredo; Serap Aksoy; T. Nicolai Siegel; Monica R. Mugnier
Pubblicato in: Nature, 2024, ISSN 1476-4687
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41586-024-08151-Z

SLAM-seq reveals independent contributions of RNA processing and stability to gene expression in African trypanosomes

Autori: Vanessa Luzak; Esteban Osses; Anna Danese; Christoff Odendaal; Raúl O Cosentino; Stefan H Stricker; Jurgen R Haanstra; Florian Erhard; T Nicolai Siegel
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE1203

Smoother: on-the-fly processing of interactome data using prefix sums

Autori: Markus R Schmidt; Anna Barcons-Simon; Claudia Rabuffo; T Nicolai Siegel
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE008

Genomic determinants of antigen expression hierarchy in African trypanosomes

Autori: Zhibek Keneskhanova, Kirsty R. McWilliam, Raúl O. Cosentino, Anna Barcons-Simon, Atai Dobrynin, Jaclyn E. Smith, Ines Subota, Monica R. Mugnier, Maria Colomé-Tatché, T. Nicolai Siegel
Pubblicato in: Nature, 2025, ISSN 0028-0836
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41586-025-08720-W