SPOT: A machine learning model that predicts specific substrates for transport proteins
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Autores:
Alexander Kroll, Nico Niebuhr, Gregory Butler, Martin J. Lercher
Publicado en:
PLOS Biology, Edición 22, 2024, ISSN 1545-7885
Editor:
Public Library of Science (PLOS)
DOI:
10.5281/ZENODO.14825942
Current Opinion in Structural Biology
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Autores:
Alexander Kroll; Yvan Rousset
Publicado en:
Current Opinion in Structural Biology, 2025, ISSN 0959-440X
Editor:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/J.SBI.2025.103070
A multimodal Transformer Network for protein-small molecule interactions enhances predictions of kinase inhibition and enzyme-substrate relationships
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Autores:
Alexander Kroll; Sahasra Ranjan; Martin J. Lercher
Publicado en:
PLOS Computational Biology, Edición 20, 2024, ISSN 1553-7358
Editor:
Public Library of Science (PLOS)
DOI:
10.5281/ZENODO.14825174
A general model to predict small molecule substrates of enzymes based on machine and deep learning
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Autores:
Alexander Kroll, Sahasra Ranjan, Martin K. M. Engqvist, Martin J. Lercher
Publicado en:
Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Portfolio
DOI:
10.5281/ZENODO.14834354
DeepMolecules: a web server for predicting enzyme and transporter–small molecule interactions
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Autores:
Alexander Kroll, Yvan Rousset, Thomas Spitzlei, Martin J Lercher
Publicado en:
Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 0305-1048
Editor:
Oxford University Press (OUP)
DOI:
10.1093/NAR/GKAF343
Turnover number predictions for kinetically uncharacterized enzymes using machine and deep learning
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Autores:
Alexander Kroll, Yvan Rousset, Xiao-Pan Hu, Nina A. Liebrand, Martin J. Lercher
Publicado en:
Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor:
Nature Portfolio
DOI:
10.5281/ZENODO.14834178
DLKcat cannot predict meaningful <i>k</i>cat values for mutants and unfamiliar enzymes
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Autores:
Alexander Kroll, Martin J Lercher
Publicado en:
Biology Methods and Protocols, Edición 9, 2024, ISSN 2396-8923
Editor:
Oxford University Press (OUP)
DOI:
10.5281/ZENODO.14833203