Mechanistic Systems modelling of plant environmental adaptation and CAM photosynthesis engineering

Informazioni relative al progetto

MECHSYS

ID dell’accordo di sovvenzione: 101055141

DOI

10.3030/101055141

Data della firma CE 5 Maggio 2022

Data di avvio 1 Novembre 2022

Data di completamento 31 Ottobre 2027

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 711 101,00

Contributo UE

€ 1 711 101,00

Coordinato da

HEINRICH-HEINE-UNIVERSITAET DUESSELDORF
Germany

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (7)

SPOT: A machine learning model that predicts specific substrates for transport proteins

Autori: Alexander Kroll, Nico Niebuhr, Gregory Butler, Martin J. Lercher
Pubblicato in: PLOS Biology, Numero 22, 2024, ISSN 1545-7885
Editore: Public Library of Science (PLOS)
DOI: 10.5281/ZENODO.14825942

Current Opinion in Structural Biology

Autori: Alexander Kroll; Yvan Rousset
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, 2025, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103070

A multimodal Transformer Network for protein-small molecule interactions enhances predictions of kinase inhibition and enzyme-substrate relationships

Autori: Alexander Kroll; Sahasra Ranjan; Martin J. Lercher
Pubblicato in: PLOS Computational Biology, Numero 20, 2024, ISSN 1553-7358
Editore: Public Library of Science (PLOS)
DOI: 10.5281/ZENODO.14825174

A general model to predict small molecule substrates of enzymes based on machine and deep learning

Autori: Alexander Kroll, Sahasra Ranjan, Martin K. M. Engqvist, Martin J. Lercher
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.5281/ZENODO.14834354

DeepMolecules: a web server for predicting enzyme and transporter–small molecule interactions

Autori: Alexander Kroll, Yvan Rousset, Thomas Spitzlei, Martin J Lercher
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF343

Turnover number predictions for kinetically uncharacterized enzymes using machine and deep learning

Autori: Alexander Kroll, Yvan Rousset, Xiao-Pan Hu, Nina A. Liebrand, Martin J. Lercher
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.5281/ZENODO.14834178

DLKcat cannot predict meaningful <i>k</i>cat values for mutants and unfamiliar enzymes

Autori: Alexander Kroll, Martin J Lercher
Pubblicato in: Biology Methods and Protocols, Numero 9, 2024, ISSN 2396-8923
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.5281/ZENODO.14833203