Mechanistic Systems modelling of plant environmental adaptation and CAM photosynthesis engineering

Informations projet

MECHSYS

N° de convention de subvention: 101055141

DOI

10.3030/101055141

Date de signature de la CE 5 Mai 2022

Date de début 1 Novembre 2022

Date de fin 31 Octobre 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 711 101,00

Contribution de l’UE

€ 1 711 101,00

Coordonné par

HEINRICH-HEINE-UNIVERSITAET DUESSELDORF
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (7)

SPOT: A machine learning model that predicts specific substrates for transport proteins

Auteurs: Alexander Kroll, Nico Niebuhr, Gregory Butler, Martin J. Lercher
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 22, 2024, ISSN 1545-7885
Éditeur: Public Library of Science (PLOS)
DOI: 10.5281/ZENODO.14825942

Current Opinion in Structural Biology

Auteurs: Alexander Kroll; Yvan Rousset
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, 2025, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103070

A multimodal Transformer Network for protein-small molecule interactions enhances predictions of kinase inhibition and enzyme-substrate relationships

Auteurs: Alexander Kroll; Sahasra Ranjan; Martin J. Lercher
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 20, 2024, ISSN 1553-7358
Éditeur: Public Library of Science (PLOS)
DOI: 10.5281/ZENODO.14825174

A general model to predict small molecule substrates of enzymes based on machine and deep learning

Auteurs: Alexander Kroll, Sahasra Ranjan, Martin K. M. Engqvist, Martin J. Lercher
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.5281/ZENODO.14834354

DeepMolecules: a web server for predicting enzyme and transporter–small molecule interactions

Auteurs: Alexander Kroll, Yvan Rousset, Thomas Spitzlei, Martin J Lercher
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF343

Turnover number predictions for kinetically uncharacterized enzymes using machine and deep learning

Auteurs: Alexander Kroll, Yvan Rousset, Xiao-Pan Hu, Nina A. Liebrand, Martin J. Lercher
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.5281/ZENODO.14834178

DLKcat cannot predict meaningful <i>k</i>cat values for mutants and unfamiliar enzymes

Auteurs: Alexander Kroll, Martin J Lercher
Publié dans: Biology Methods and Protocols, Numéro 9, 2024, ISSN 2396-8923
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.5281/ZENODO.14833203