Predictive REagent-Antibody Replacement Technology stage 2-Translation

Información del proyecto

PRe-ART-2T

Identificador del acuerdo de subvención: 101058027

DOI

10.3030/101058027

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 17 Marzo 2022

Fecha de inicio 1 Junio 2022

Fecha de finalización 31 Mayo 2025

Financiado con arreglo a

• The European Innovation Council (EIC)

Coste total

€ 800 000,00

Aportación de la UE

€ 800 000,00

Coordinado por

UNIVERSITAT BAYREUTH
Germany

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Resultado final

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Publicaciones

Peer reviewed articles (8)

Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies

Autores: Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Publicado en: Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Editor: De Gruyter
DOI: 10.1515/hsz-2021-0384

Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides

Autores: Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43596-2

Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules

Autores: Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editor: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2318198121

Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design

Autores: Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Publicado en: Biochemistry, Edición 62, 2022, ISSN 0006-2960
Editor: ACS
DOI: 10.1021/acs.biochem.2c00083

Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.

Autores: Kynast J.P., Höcker B.
Publicado en: Biodesign Research, Edición 5, 2023, ISSN 2693-1257
Editor: Science Partner Journals
DOI: 10.34133/bdr.0011

Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities

Autores: Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Publicado en: Journal of Computational Chemistry, Edición 46, 2025, ISSN 0192-8651
Editor: Wiley
DOI: 10.1002/JCC.70160

PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design

Autores: Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Publicado en: Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Editor: Wiley
DOI: 10.1002/pro.4516

ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach

Autores: Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Publicado en: Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Editor: ISCB
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac685

Conference proceedings (2)

Computational design of specific binding pockets for phosphorylated amino acids within Armadillo repeat proteins

Autores: Ayyildiz, M.
Publicado en: 74th Mosbacher Kolloquium on Immune engineering, Edición Abstract O 03, 2023
Editor: German Society for Biochemistry and Molecular Biology website

PRe-ART - Creating synthetic replacements for reagent antibodies

Autores: Chembath, A., Ashraf, M., Wagstaffe, B.P.G., Stark, Y., Michel, E., Rohrbach, A., Kynast, J., Gisdon, F., Ayyildiz, M., Höcker, B., Plückthun, A., Hine, A.V.
Publicado en: Synthetic Biology UK, 2022, Edición Abstract P043, 2022
Editor: Biochemical Society