Predictive REagent-Antibody Replacement Technology stage 2-Translation

Informations projet

PRe-ART-2T

N° de convention de subvention: 101058027

DOI

10.3030/101058027

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Mars 2022

Date de début 1 Juin 2022

Date de fin 31 Mai 2025

Financé au titre de

• The European Innovation Council (EIC)

Coût total

€ 800 000,00

Contribution de l’UE

€ 800 000,00

Coordonné par

UNIVERSITAT BAYREUTH
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

New, Externally-hosted PRe-ART website and project logo

New Externallyhosted PReART website created and project logo

Publications

Peer reviewed articles (8)

Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies

Auteurs: Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Publié dans: Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Éditeur: De Gruyter
DOI: 10.1515/hsz-2021-0384

Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides

Auteurs: Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43596-2

Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules

Auteurs: Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2318198121

Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design

Auteurs: Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Publié dans: Biochemistry, Numéro 62, 2022, ISSN 0006-2960
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acs.biochem.2c00083

Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.

Auteurs: Kynast J.P., Höcker B.
Publié dans: Biodesign Research, Numéro 5, 2023, ISSN 2693-1257
Éditeur: Science Partner Journals
DOI: 10.34133/bdr.0011

Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities

Auteurs: Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Publié dans: Journal of Computational Chemistry, Numéro 46, 2025, ISSN 0192-8651
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/JCC.70160

PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design

Auteurs: Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Publié dans: Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/pro.4516

ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach

Auteurs: Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Publié dans: Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Éditeur: ISCB
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac685

Conference proceedings (2)

Computational design of specific binding pockets for phosphorylated amino acids within Armadillo repeat proteins

Auteurs: Ayyildiz, M.
Publié dans: 74th Mosbacher Kolloquium on Immune engineering, Numéro Abstract O 03, 2023
Éditeur: German Society for Biochemistry and Molecular Biology website

PRe-ART - Creating synthetic replacements for reagent antibodies

Auteurs: Chembath, A., Ashraf, M., Wagstaffe, B.P.G., Stark, Y., Michel, E., Rohrbach, A., Kynast, J., Gisdon, F., Ayyildiz, M., Höcker, B., Plückthun, A., Hine, A.V.
Publié dans: Synthetic Biology UK, 2022, Numéro Abstract P043, 2022
Éditeur: Biochemical Society