Predictive REagent-Antibody Replacement Technology stage 2-Translation

Informazioni relative al progetto

PRe-ART-2T

ID dell’accordo di sovvenzione: 101058027

DOI

10.3030/101058027

Progetto chiuso

Data della firma CE 17 Marzo 2022

Data di avvio 1 Giugno 2022

Data di completamento 31 Maggio 2025

Finanziato da

• The European Innovation Council (EIC)

Costo totale

€ 800 000,00

Contributo UE

€ 800 000,00

Coordinato da

UNIVERSITAT BAYREUTH
Germany

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

New, Externally-hosted PRe-ART website and project logo

New Externallyhosted PReART website created and project logo

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies

Autori: Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Pubblicato in: Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Editore: De Gruyter
DOI: 10.1515/hsz-2021-0384

Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides

Autori: Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43596-2

Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules

Autori: Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2318198121

Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design

Autori: Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Pubblicato in: Biochemistry, Numero 62, 2022, ISSN 0006-2960
Editore: ACS
DOI: 10.1021/acs.biochem.2c00083

Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.

Autori: Kynast J.P., Höcker B.
Pubblicato in: Biodesign Research, Numero 5, 2023, ISSN 2693-1257
Editore: Science Partner Journals
DOI: 10.34133/bdr.0011

Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities

Autori: Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Pubblicato in: Journal of Computational Chemistry, Numero 46, 2025, ISSN 0192-8651
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/JCC.70160

PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design

Autori: Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Pubblicato in: Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/pro.4516

ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach

Autori: Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Pubblicato in: Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Editore: ISCB
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac685

Conference proceedings (2)

Computational design of specific binding pockets for phosphorylated amino acids within Armadillo repeat proteins

Autori: Ayyildiz, M.
Pubblicato in: 74th Mosbacher Kolloquium on Immune engineering, Numero Abstract O 03, 2023
Editore: German Society for Biochemistry and Molecular Biology website

PRe-ART - Creating synthetic replacements for reagent antibodies

Autori: Chembath, A., Ashraf, M., Wagstaffe, B.P.G., Stark, Y., Michel, E., Rohrbach, A., Kynast, J., Gisdon, F., Ayyildiz, M., Höcker, B., Plückthun, A., Hine, A.V.
Pubblicato in: Synthetic Biology UK, 2022, Numero Abstract P043, 2022
Editore: Biochemical Society