Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies
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Autori:
Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Pubblicato in:
Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Editore:
De Gruyter
DOI:
10.1515/hsz-2021-0384
Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides
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Autori:
Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Pubblicato in:
Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-43596-2
Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules
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Autori:
Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Pubblicato in:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore:
Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/PNAS.2318198121
Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design
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Autori:
Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Pubblicato in:
Biochemistry, Numero 62, 2022, ISSN 0006-2960
Editore:
ACS
DOI:
10.1021/acs.biochem.2c00083
Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.
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Autori:
Kynast J.P., Höcker B.
Pubblicato in:
Biodesign Research, Numero 5, 2023, ISSN 2693-1257
Editore:
Science Partner Journals
DOI:
10.34133/bdr.0011
Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities
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Autori:
Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Pubblicato in:
Journal of Computational Chemistry, Numero 46, 2025, ISSN 0192-8651
Editore:
Wiley
DOI:
10.1002/JCC.70160
PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design
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Autori:
Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Pubblicato in:
Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Editore:
Wiley
DOI:
10.1002/pro.4516
ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach
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Autori:
Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Pubblicato in:
Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Editore:
ISCB
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac685
