Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Opublikowane w:
Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Wydawca:
De Gruyter
DOI:
10.1515/hsz-2021-0384
Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Opublikowane w:
Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-023-43596-2
Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Opublikowane w:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 121, 2024, ISSN 0027-8424
Wydawca:
Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/PNAS.2318198121
Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Opublikowane w:
Biochemistry, Numer 62, 2022, ISSN 0006-2960
Wydawca:
ACS
DOI:
10.1021/acs.biochem.2c00083
Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Kynast J.P., Höcker B.
Opublikowane w:
Biodesign Research, Numer 5, 2023, ISSN 2693-1257
Wydawca:
Science Partner Journals
DOI:
10.34133/bdr.0011
Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Opublikowane w:
Journal of Computational Chemistry, Numer 46, 2025, ISSN 0192-8651
Wydawca:
Wiley
DOI:
10.1002/JCC.70160
PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Opublikowane w:
Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Wydawca:
Wiley
DOI:
10.1002/pro.4516
ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Opublikowane w:
Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Wydawca:
ISCB
DOI:
10.1093/bioinformatics/btac685