Predictive REagent-Antibody Replacement Technology stage 2-Translation

Informacje na temat projektu

PRe-ART-2T

Identyfikator umowy o grant: 101058027

DOI

10.3030/101058027

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 17 Marca 2022

Data rozpoczęcia 1 Czerwca 2022

Data zakończenia 31 Maja 2025

Finansowanie w ramach

• The European Innovation Council (EIC)

Koszt całkowity

€ 800 000,00

Wkład UE

€ 800 000,00

Koordynowany przez

UNIVERSITAT BAYREUTH
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

New, Externally-hosted PRe-ART website and project logo

New Externallyhosted PReART website created and project logo

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

Modular peptide binders – development of a predictive technology as alternative for reagent antibodies

Autorzy: Plückthun, A. , Gisdon, F.J., Kynast, J.P. Ayyildiz, M., Hine, A. V., Höcker, B.
Opublikowane w: Biol. Chem., 2022, ISSN 1083-351X
Wydawca: De Gruyter
DOI: 10.1515/hsz-2021-0384

Unexpected dynamics in femtomolar complexes of binding proteins with peptides

Autorzy: Cucuzza, S., Sitnik, M., Jurt, S., Michel, E., Dai, W., Müntener, T., Ernst, P., Häussinger, D., Plückthun, A. & Zerbe, O.
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43596-2

Modular binder technology by NGS-aided, high-resolution selection in yeast of designed armadillo modules

Autorzy: Yvonne Stark, Faye Menard, Jeliazko R. Jeliazkov, Patrick Ernst, Anupama Chembath, Mohammed Ashraf, Anna V. Hine, Andreas Plückthun
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 121, 2024, ISSN 0027-8424
Wydawca: Proceedings of the National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2318198121

Improved Repeat Protein Stability by Combined Consensus and Computational Protein Design

Autorzy: Michel, E., Cucuzza, S., Mittl, P.R.E., Zerbe, O., Plückthun, A.
Opublikowane w: Biochemistry, Numer 62, 2022, ISSN 0006-2960
Wydawca: ACS
DOI: 10.1021/acs.biochem.2c00083

Atligator Web: A Graphical User Interface for Analysis and Design of Protein–Peptide Interactions.

Autorzy: Kynast J.P., Höcker B.
Opublikowane w: Biodesign Research, Numer 5, 2023, ISSN 2693-1257
Wydawca: Science Partner Journals
DOI: 10.34133/bdr.0011

Evaluation of Physics‐Based Protein Design Methods for Predicting Single Residue Effects on Peptide Binding Specificities

Autorzy: Merve Ayyildiz, Jakob Noske, Florian J. Gisdon, Josef P. Kynast, Birte Höcker
Opublikowane w: Journal of Computational Chemistry, Numer 46, 2025, ISSN 0192-8651
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/JCC.70160

PocketOptimizer 2.0: A modular framework for computer-aided ligand-binding design

Autorzy: Noske, J., Kynast, J.P., Lemm, D., Schmidt, S. & Höcker, B.
Opublikowane w: Protein Science, 2022, ISSN 0961-8368
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/pro.4516

ATLIGATOR: Editing protein interactions with an atlas-based approach

Autorzy: Kynast J.P., Schwägerl F., Höcker B
Opublikowane w: Bioinformatics, 2022, ISSN 0000-0000
Wydawca: ISCB
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac685

Conference proceedings (2)

Computational design of specific binding pockets for phosphorylated amino acids within Armadillo repeat proteins

Autorzy: Ayyildiz, M.
Opublikowane w: 74th Mosbacher Kolloquium on Immune engineering, Numer Abstract O 03, 2023
Wydawca: German Society for Biochemistry and Molecular Biology website

PRe-ART - Creating synthetic replacements for reagent antibodies

Autorzy: Chembath, A., Ashraf, M., Wagstaffe, B.P.G., Stark, Y., Michel, E., Rohrbach, A., Kynast, J., Gisdon, F., Ayyildiz, M., Höcker, B., Plückthun, A., Hine, A.V.
Opublikowane w: Synthetic Biology UK, 2022, Numer Abstract P043, 2022
Wydawca: Biochemical Society