Description du projet DEENESFRITPL Comprendre le vieillissement à partir de la régulation transcriptionnelle bactérienne Les facteurs sigma sont les principaux constituants de la régulation transcriptionnelle chez les bactéries et jouent un rôle clé dans la régulation de l’expression des gènes en réponse aux changements environnementaux. Ils pourraient donner un aperçu de l’hétérogénéité du vieillissement entre les individus, qui va au-delà des bactéries et est observée dans diverses populations, notamment chez les humains. La compréhension scientifique du contrôle moléculaire du vieillissement par les voies génétiques et métaboliques n’explique pas entièrement cette hétérogénéité, démontrée par des taux et des modèles de vieillissement différents et même observée dans le cadre d’une génétique et d’un environnement fixes. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet ASNet combinera des techniques expérimentales de haute technologie et des modélisations mathématiques en vue d’élucider les rôles et les mécanismes des quatre facteurs sigma dans les processus de vieillissement des cellules bactériennes individuelles. Afficher les objectifs du projet Masquer les objectifs du projet Objectif Ageing is controlled at the molecular level via genetic and metabolic pathways. Ageing rates and patterns vary substantially even with fixed genetics and environment. However, molecular mechanisms of ageing generating individual heterogeneity are poorly understood. Stochastic dynamics of gene expression can be a main source of the variation in cellular damage dynamics leading to individual heterogeneity in ageing. The sigma factor regulatory networks constitute the core part of the bacterial gene expression networks and therefore play important role in deciding the fate of bacterial cells. In this project, I focus on exploring the role and interplays of four major sigma factors rpoD, rpoS, rpoH, rpoN in individual E. coli cells. I plan to (1) obtain these sigma factors’ expression dynamics and the demographic fates at individual E. coli cells in microfluidic platforms under fluorescent microscope; (2) process and analyze big image data in an automated manner; (3) develop mathematical models to interpret expression and demographic signals for damage and ageing. I will combine the knowledge and methods from the disciplines of molecular biology, genetics, fluorescent microscopy and microfluidics, machine learning, population and evolutionary dynamics and mathematical modelling to shed light on the link from stochastic expression dynamics in sigma factor regulatory network towards individual variations observed in ageing fates. Champ scientifique natural sciencesphysical sciencesclassical mechanicsfluid mechanicsmicrofluidicsnatural sciencesbiological sciencesgeneticsnatural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriologynatural sciencesbiological sciencesevolutionary biologynatural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model Programme(s) HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme Thème(s) HORIZON-MSCA-2021-PF-01-01 - MSCA Postdoctoral Fellowships 2021 Appel à propositions HORIZON-MSCA-2021-PF-01 Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement HORIZON-AG-UN - HORIZON Unit Grant Coordinateur FREIE UNIVERSITAET BERLIN Contribution nette de l'UE € 189 687,36 Adresse KAISERSWERTHER STRASSE 16-18 14195 Berlin Allemagne Voir sur la carte Région Berlin Berlin Berlin Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total Aucune donnée
