Descrizione del progetto DEENESFRITPL La regolazione trascrizionale dei batteri per comprendere l’invecchiamento I fattori sigma sono i principali costituenti della regolazione della trascrizione nei batteri e svolgono un ruolo chiave nella regolazione dell’espressione genica in risposta ai cambiamenti ambientali. Tali fattori potrebbero fornire una visione approfondita dell’eterogeneità dell’invecchiamento fra gli individui, al di là dei batteri e osservata in varie popolazioni, fra cui gli esseri umani. La comprensione scientifica del controllo molecolare dell’invecchiamento attraverso le vie genetiche e metaboliche non spiega completamente questa eterogeneità, dimostrata da tassi e modelli di invecchiamento diversi e osservata anche in presenza di genetica e ambiente fissi. Grazie al sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto ASNet combinerà tecniche sperimentali ad alta tecnologia con la modellazione matematica per chiarire i ruoli e i meccanismi dei quattro fattori sigma nei processi di invecchiamento delle singole cellule batteriche. Mostra l’obiettivo del progetto Nascondi l’obiettivo del progetto Obiettivo Ageing is controlled at the molecular level via genetic and metabolic pathways. Ageing rates and patterns vary substantially even with fixed genetics and environment. However, molecular mechanisms of ageing generating individual heterogeneity are poorly understood. Stochastic dynamics of gene expression can be a main source of the variation in cellular damage dynamics leading to individual heterogeneity in ageing. The sigma factor regulatory networks constitute the core part of the bacterial gene expression networks and therefore play important role in deciding the fate of bacterial cells. In this project, I focus on exploring the role and interplays of four major sigma factors rpoD, rpoS, rpoH, rpoN in individual E. coli cells. I plan to (1) obtain these sigma factors’ expression dynamics and the demographic fates at individual E. coli cells in microfluidic platforms under fluorescent microscope; (2) process and analyze big image data in an automated manner; (3) develop mathematical models to interpret expression and demographic signals for damage and ageing. I will combine the knowledge and methods from the disciplines of molecular biology, genetics, fluorescent microscopy and microfluidics, machine learning, population and evolutionary dynamics and mathematical modelling to shed light on the link from stochastic expression dynamics in sigma factor regulatory network towards individual variations observed in ageing fates. Campo scientifico natural sciencesphysical sciencesclassical mechanicsfluid mechanicsmicrofluidicsnatural sciencesbiological sciencesgeneticsnatural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriologynatural sciencesbiological sciencesevolutionary biologynatural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model Programma(i) HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme Argomento(i) HORIZON-MSCA-2021-PF-01-01 - MSCA Postdoctoral Fellowships 2021 Invito a presentare proposte HORIZON-MSCA-2021-PF-01 Vedi altri progetti per questo bando Meccanismo di finanziamento HORIZON-AG-UN - HORIZON Unit Grant Coordinatore FREIE UNIVERSITAET BERLIN Contribution nette de l'UE € 189 687,36 Indirizzo KAISERSWERTHER STRASSE 16-18 14195 Berlin Germania Mostra sulla mappa Regione Berlin Berlin Berlin Tipo di attività Higher or Secondary Education Establishments Collegamenti Contatta l’organizzazione Opens in new window Sito web Opens in new window Partecipazione a programmi di R&I dell'UE Opens in new window Rete di collaborazione HORIZON Opens in new window Costo totale Nessun dato
