Opis projektu DEENESFRITPL Odkrywanie tajemnic starzenia się na podstawie regulacji transkrypcji u bakterii Czynniki sigma są głównymi składnikami regulacji transkrypcji u bakterii, odgrywając kluczową rolę w regulacji ekspresji genów w odpowiedzi na zmiany środowiskowe. Dzięki nim możliwe jest lepsze poznanie heterogenicznego charakteru starzenia się wśród różnych osobników, co jest obserwowane nie tylko u bakterii, ale także w innych populacjach, w tym u ludzi. Naukowe zrozumienie molekularnej kontroli procesu starzenia się za pośrednictwem szlaków genetycznych i metabolicznych nie wyjaśnia w pełni wspomnianej heterogeniczności, której przejawem jest różne tempo i wzorce starzenia się, obserwowanej nawet w przypadku braku zmian w genetyce czy środowisku. Dzięki wsparciu działań „Maria Skłodowska-Curie” zrealizowany zostanie projekt ASNet, w którym wysoce zaawansowane techniki eksperymentalne zostaną połączone z modelowaniem matematycznym w celu wyjaśnienia roli czterech czynników sigma w procesach starzenia się pojedynczych komórek bakteryjnych, a także mechanizmów ich działania. Pokaż cel projektu Ukryj cel projektu Cel Ageing is controlled at the molecular level via genetic and metabolic pathways. Ageing rates and patterns vary substantially even with fixed genetics and environment. However, molecular mechanisms of ageing generating individual heterogeneity are poorly understood. Stochastic dynamics of gene expression can be a main source of the variation in cellular damage dynamics leading to individual heterogeneity in ageing. The sigma factor regulatory networks constitute the core part of the bacterial gene expression networks and therefore play important role in deciding the fate of bacterial cells. In this project, I focus on exploring the role and interplays of four major sigma factors rpoD, rpoS, rpoH, rpoN in individual E. coli cells. I plan to (1) obtain these sigma factors’ expression dynamics and the demographic fates at individual E. coli cells in microfluidic platforms under fluorescent microscope; (2) process and analyze big image data in an automated manner; (3) develop mathematical models to interpret expression and demographic signals for damage and ageing. I will combine the knowledge and methods from the disciplines of molecular biology, genetics, fluorescent microscopy and microfluidics, machine learning, population and evolutionary dynamics and mathematical modelling to shed light on the link from stochastic expression dynamics in sigma factor regulatory network towards individual variations observed in ageing fates. Dziedzina nauki natural sciencesphysical sciencesclassical mechanicsfluid mechanicsmicrofluidicsnatural sciencesbiological sciencesgeneticsnatural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriologynatural sciencesbiological sciencesevolutionary biologynatural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model Program(-y) HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme Temat(-y) HORIZON-MSCA-2021-PF-01-01 - MSCA Postdoctoral Fellowships 2021 Zaproszenie do składania wniosków HORIZON-MSCA-2021-PF-01 Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia System finansowania HORIZON-AG-UN - HORIZON Unit Grant Koordynator FREIE UNIVERSITAET BERLIN Wkład UE netto € 189 687,36 Adres KAISERSWERTHER STRASSE 16-18 14195 Berlin Niemcy Zobacz na mapie Region Berlin Berlin Berlin Rodzaj działalności Higher or Secondary Education Establishments Linki Kontakt z organizacją Opens in new window Strona internetowa Opens in new window Uczestnictwo w unijnych programach w zakresie badań i innowacji Opens in new window sieć współpracy HORIZON Opens in new window Koszt całkowity Brak danych
