Projektbeschreibung
Innovative Methode zur Diagnostik von Antibiotikaresistenzen
Die antimikrobielle Resistenz (AMR) ist weltweit für Millionen Todesfälle verantwortlich. Sie wird mit dem Missbrauch und der übermäßigen Verschreibung von Antibiotika in Verbindung gebracht. Die Entwicklung von Schnelldiagnoseverfahren beruht auf Bakterienkulturen, die zeitaufwändig und oft ineffizient sind. Auf der Grundlage einer in früheren ERC-Forschungsarbeiten erarbeiteten Technologie wurde ein neuer Ansatz konzipiert, um bakterielle RNS innerhalb von Minuten zu isolieren. Im Rahmen des ERC-finanzierten Projekts ResisCHIP werden diese Instrumente in Kombination mit einem schnellen RNS-Chip-Array mit Einzelmolekülauflösung entwickelt und validiert. So wird ein maßgeschneidertes, kulturfreies Diagnoseinstrument bereitgestellt, mit dem Tausende Gene und Krankheitserreger aus einer Blutprobe in weniger als zwei Stunden identifiziert werden können, wodurch die bestmögliche Behandlung sichergestellt wird.
Ziel
Drug-resistant infections are one of the greatest threats facing humanity. Antimicrobial resistance (AMR) causes over 700.000 deaths each year. Furthermore, AMR is associated to reduced quality of life, increased hospitalization periods and medical costs. Misuse and over-prescription of antibiotics for human or animal treatment are one of the drivers of AMR. At the same time, the development of new antibiotics is virtually nonexistent. Hence, developing fast diagnostic methods to identify the optimal treatment is key to effectively fight AMR and increase survival rates of patients encountering life-threatening infections. So far, diagnostics rely on bacterial cultures, leading to slow turnaround times, which are linked to the preventive administration of broad-spectrum antibiotics, often inefficient and leading to worse disease outcomes and spread of AMR. Novel approaches such as DNA PCR-based diagnostic panels or next generation sequencing methods have been recently proposed to address this issue. However, they are target a limited number of pathogens and genes or require expensive equipment and highly-trained personnel. Furthermore, they require a culture step to reach detection levels, usually lasting a few hours, that can be critical for serious conditions. Recently, using technology derived from ERC StG and PoC grants, we designed a method to concentrate, purify, and isolate bacterial RNA in just 5 minutes. Here, we seek to develop and validate these tools, combined with a rapid RNA chip array with single-molecule resolution, to provide a culture-free, fast, and highly sensitive alternative to bacterial infection diagnostics from direct blood samples. Once developed, ResisCHIP will provide a tailor-made diagnostic kit with the capacity to identify thousands of genes and pathogens from a blood sample in less than 2 hours, allowing the rapid selection of the best treatment, improving AMR stewardess, and becoming a significant breakthrough in AMR diagnostics.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht.
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- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikDNS
- Medizin- und GesundheitswissenschaftenGrundlagenmedizinPharmakologie und PharmazieArzneimittelAntibiotikum
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikRNS
- Medizin- und GesundheitswissenschaftenGrundlagenmedizinPharmakologie und PharmazieArzneimittelresistenzAntibiotikaresistenzen
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Spanien