Descrizione del progetto
Un metodo diagnostico innovativo della resistenza agli antibiotici
L’antibiotico-resistenza (AMR), che è associata all’uso improprio e alla prescrizione eccessiva di antibiotici, è responsabile di oltre un milione di decessi in tutto il mondo. Lo sviluppo di metodi diagnostici rapidi si basa su colture batteriche che richiedono tempo e sono spesso inefficienti. Per isolare l’RNA batterico in pochi minuti, è stato progettato un nuovo approccio basato su una tecnologia sviluppata da precedenti ricerche del CER. Il progetto ResisCHIP, finanziato dal CER, svilupperà e convaliderà questi strumenti combinati con un chip array di RNA rapido con risoluzione a singola molecola. Il progetto fornirà un kit diagnostico su misura e privo di colture in grado di identificare migliaia di geni e agenti patogeni da un campione di sangue in meno di due ore, consentendo la rapida selezione del trattamento migliore.
Obiettivo
Drug-resistant infections are one of the greatest threats facing humanity. Antimicrobial resistance (AMR) causes over 700.000 deaths each year. Furthermore, AMR is associated to reduced quality of life, increased hospitalization periods and medical costs. Misuse and over-prescription of antibiotics for human or animal treatment are one of the drivers of AMR. At the same time, the development of new antibiotics is virtually nonexistent. Hence, developing fast diagnostic methods to identify the optimal treatment is key to effectively fight AMR and increase survival rates of patients encountering life-threatening infections. So far, diagnostics rely on bacterial cultures, leading to slow turnaround times, which are linked to the preventive administration of broad-spectrum antibiotics, often inefficient and leading to worse disease outcomes and spread of AMR. Novel approaches such as DNA PCR-based diagnostic panels or next generation sequencing methods have been recently proposed to address this issue. However, they are target a limited number of pathogens and genes or require expensive equipment and highly-trained personnel. Furthermore, they require a culture step to reach detection levels, usually lasting a few hours, that can be critical for serious conditions. Recently, using technology derived from ERC StG and PoC grants, we designed a method to concentrate, purify, and isolate bacterial RNA in just 5 minutes. Here, we seek to develop and validate these tools, combined with a rapid RNA chip array with single-molecule resolution, to provide a culture-free, fast, and highly sensitive alternative to bacterial infection diagnostics from direct blood samples. Once developed, ResisCHIP will provide a tailor-made diagnostic kit with the capacity to identify thousands of genes and pathogens from a blood sample in less than 2 hours, allowing the rapid selection of the best treatment, improving AMR stewardess, and becoming a significant breakthrough in AMR diagnostics.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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- scienze naturaliscienze biologichegeneticaDNA
- scienze mediche e della salutemedicina di basefarmacologia e farmaciafarmaciantibiotici
- scienze naturaliscienze biologichegeneticaRNA
- scienze mediche e della salutemedicina di basefarmacologia e farmaciafarmacoresistenzaresistenza agli antibiotici
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Programma(i)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
ERC-POC - Proof of Concept GrantIstituzione ospitante
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna