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Decipher cytochrome P450 enzymes (CYPs) by digital tools to produce flavonoids and terpenoids

Descrizione del progetto

Un canale innovativo per la produzione microbica di metaboliti vegetali

La produzione microbica di metaboliti vegetali offre vantaggi economici e ambientali rispetto ai metodi chimici e di estrazione tradizionalmente impiegati in tal ambito. Tuttavia, la produzione microbica di metaboliti vegetali ossigenati mediata dagli enzimi del citocromo P450 non è stata sinora sufficientemente esplorata. Nonostante la loro rapida evoluzione, gli strumenti di intelligenza artificiale (IA) e di apprendimento automatico (AA) hanno applicazioni molto limitate nella biologia ingegneristica. Il progetto deCYPher, finanziato dall’UE, si prefigge di sviluppare e applicare un canale di IA e AA standardizzato in ogni fase del ciclo di progettazione-costruzione-test-apprendimento esistente nella catena del valore biotecnologico, nonché di liberare il potenziale delle molecole dei metaboliti vegetali ossigenati. L’obiettivo è contribuire al Green deal europeo attraverso la transizione verso una bioeconomia circolare, migliorando la sostenibilità delle catene del valore biocompatibili.

Obiettivo

Microbial production of plant metabolites has economic & environmental benefits over traditional extraction and chemical methods. Despite initial progress & the successful market introduction of some molecules, the microbial production of oxygenated plant metabolites (OPMs) mediated by cytochrome P450 enzymes (CYPs) is still lagging, making them almost inaccessible to society. In contrast, artificial intelligence (AI) & machine learning (ML) tools are evolving rapidly, but their use for engineering biology is still underexplored. deCYPher applies these groundbreaking AI/ML techniques to unlock the OPM molecules to society.

deCYPher develops a standardised AI/ML pipeline to implement AI/ML in each step of the Design-Build-Test-Learn cycle, and across all steps in the biotech value chain. Combined with smart databases & synthetic biology (SynBio) tools, this AI/ML pipeline will generate opportunities for the whole biotech sector. Specifically, applied to OPMs, we (1) bioprospect & select specific CYPs, (2) correctly localise & express CYPs and (3) optimise the microbial cells & bioprocess. deCYPher involves stakeholders (industry, regulators, NGOs) and engages European citizens across several countries. This allows to reflect on the societal ramifications of the convergence of AI & SynBio.

The consortium brings together complementary expertise from 5 top RTOs, 3 SMEs, 1 LE & 1 bio-art association from 6 EU countries to unlock the full potential of OPMs. In parallel, deCYPher will enable the AI/ML sector to apply their tools in the biotech sector, by creating new production tools for industrial biotech and specifically impact industry (flavours & fragrances, phytonutrient) and society with novel products. deCYPher contributes to the EU green deal, supports the transition to a circular bioeconomy, increases resource efficiency, strengthens European competitiveness, innovates in a responsible and reflective manner & boosts sustainability of biobased value chains.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation Actions

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-CL6-2022-CIRCBIO-02-two-stage

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITEIT GENT
Contributo netto dell'UE
€ 1 172 062,50
Indirizzo
SINT PIETERSNIEUWSTRAAT 25
9000 Gent
Belgio
Regione
Vlaams Gewest Prov. Oost-Vlaanderen Arr. Gent
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 1 172 062,50

Partecipanti (10)