Objetivo
RNA is common to all organisms. Despite its major function as the coding agent for protein synthesis, an increasing number of regulatory roles have been assigned to RNA. In bacteria, small RNAs (sRNAs) constitute the best-studied class of non-coding regulators estimated to control ~20% of all genes in a given organism. Most sRNAs affect gene expression by base-pairing with multiple target mRNAs resulting in either gene repression or activation. sRNA regulators are modular, versatile, and highly programmable, and thus have gathered momentum as control devices in synthetic biology and biotechnology.
My group has recently established artificial sRNAs as a potent genetic tool to screen, detect, and characterize microbial phenotypes. We have now extended this method by a novel sequencing approach, called LIGseq, allowing us to map sRNA-target interactions at the population level and in a high throughput manner. We have further shown that sRNAs expressed from the 3’ untranslated regions (UTRs) of mRNAs can serve as tuneable autoregulatory elements and thus bear ample possibilities for the design of artificial gene networks. I therefore posit that artificial sRNAs are powerful, yet understudied control elements of the synthetic biology toolbox with largely untapped regulatory potentials.
I thus propose to: 1) exploit artificial sRNAs to investigate the molecular principles underlying target selection and RNA duplex formation by bacterial non-coding RNAs, 2) harness the power of artificial sRNAs to study essential gene functions and the mechanisms underlying antibiotic resistance in bacteria, 3) employ 3’UTR-derived sRNAs as programmable feedback devices in synthetic gene regulatory circuits.
This combined work will generate the molecular framework to employ artificial sRNAs for synthetic biology applications and shed new light on medically relevant processes, such as antibiotic resistance of microbial pathogens.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
07743 JENA
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.