Objectif
RNA is common to all organisms. Despite its major function as the coding agent for protein synthesis, an increasing number of regulatory roles have been assigned to RNA. In bacteria, small RNAs (sRNAs) constitute the best-studied class of non-coding regulators estimated to control ~20% of all genes in a given organism. Most sRNAs affect gene expression by base-pairing with multiple target mRNAs resulting in either gene repression or activation. sRNA regulators are modular, versatile, and highly programmable, and thus have gathered momentum as control devices in synthetic biology and biotechnology.
My group has recently established artificial sRNAs as a potent genetic tool to screen, detect, and characterize microbial phenotypes. We have now extended this method by a novel sequencing approach, called LIGseq, allowing us to map sRNA-target interactions at the population level and in a high throughput manner. We have further shown that sRNAs expressed from the 3’ untranslated regions (UTRs) of mRNAs can serve as tuneable autoregulatory elements and thus bear ample possibilities for the design of artificial gene networks. I therefore posit that artificial sRNAs are powerful, yet understudied control elements of the synthetic biology toolbox with largely untapped regulatory potentials.
I thus propose to: 1) exploit artificial sRNAs to investigate the molecular principles underlying target selection and RNA duplex formation by bacterial non-coding RNAs, 2) harness the power of artificial sRNAs to study essential gene functions and the mechanisms underlying antibiotic resistance in bacteria, 3) employ 3’UTR-derived sRNAs as programmable feedback devices in synthetic gene regulatory circuits.
This combined work will generate the molecular framework to employ artificial sRNAs for synthetic biology applications and shed new light on medically relevant processes, such as antibiotic resistance of microbial pathogens.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
07743 JENA
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.