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Repurposing of CAST Systems as Next-Generation Tools for Genome Engineering of Mammalian Cells

Ziel

Genome editing using RNA-guided CRISPR-Cas nucleases (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats that associate with CRISPR associated proteins) has radically altered life sciences, enabling genome manipulation in living organisms. However, their use is limited by dependence on DNA Damage Response (DDR), which restricts genome editing to dividing cells. Further, these nucleases cannot handle DNA cargos large enough to harbour regulatory DNA circuitry, thus precluding genome engineering. In INTETOOLS, I will overcome these limitations by dissecting and repurposing CRISPR Associated Transposon (CAST) systems into genome engineering tools. CASTs are naturally occurring prokaryotic protein–RNA machineries consisting of an inactive CRISPR effector complex, which associate with Tn7 family transposons to insert large DNA cargos. Knowledge of their molecular mechanisms is scarce, which prevents their practical application in genome engineering. Accordingly, in Objective 1, I will investigate the architecture of different CASTs to obtain fundamental knowledge of their RNA-guided integration. I will then use this knowledge in Objective 2, to dissect their mechanism underpinnings whereby CRISPR-Cas complexes associate with transposition complexes to insert with nucleotide accuracy DNA cargos. This will inform Objective 3, where I will design new CAST tools that will allow RNA-guided transposition in eukaryotic genomes. These revamped CASTs will be capable of inserting large DNAs with high precision, harbouring regulatory regions into eukaryotic genomes, enabling genome engineering in eukaryotes. I will test the redesigned CASTs in mammalian cell lines and at the organismal level by rescuing the eyeless mutant phenotype in Drosophila melanogaster. INTETOOLS will catalyse a conceptual leap propelling the field into a new era of genome engineering, with major biomedical and biotechnological applications especially in synthetic biology.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2022-ADG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 475 491,00
Adresse
NORREGADE 10
1165 KOBENHAVN
Dänemark

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Region
Danmark Hovedstaden Byen København
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 475 491,00

Begünstigte (1)

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