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Understanding the role and biogenesis of transfer RNA-derived small RNAs in plants

Projektbeschreibung

Profil eines weitgehend nicht charakterisierten, auf Stress reagierenden regulatorischen Netzwerks in Pflanzen erstellen

Transfer-RNA-Moleküle transportieren die Aminosäuren während der Proteinsynthese zu den Ribosomen. Von der Transfer-RNA abgeleitete kleine RNAs (tsRNAs) stellen eine Art von nicht-kodierender tRNA dar, von der allgemein bekannt ist, dass sie für die Proteintranslation wesentlich ist. Obwohl es Hinweise darauf gibt, dass diese Moleküle in Pflanzen unter Stressbedingungen in hohem Maße exprimiert werden, ist unklar, welche Mechanismen zu ihrer Anhäufung führen, welche biologischen Prozesse sie beeinflussen oder welche Wirkmechanismen sie haben. Als ein weitgehend nicht charakterisiertes, auf Stress reagierendes regulatorisches Netzwerk in Pflanzen birgt dieses System ein enormes Potenzial für Anwendungen in der Landwirtschaft. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen ist im Projekt UNROOT geplant, den genauen Mechanismus, die Gesamtwirkung und die gesamte Population von tsRNAs in Pflanzen zu erforschen.

Ziel

This proposal aims to explore the precise mechanism, overall impact and complete population of the small RNAs derived of transfer RNAs (tsRNAs) in plants. The proposed research would be carried out in a laboratory that specializes in RNA regulation and that made substantial contributions to the plant tRNA-derived sRNA field (Dr. German Martinez). Although it has been described that these molecules are highly expressed in stress conditions, we still lack a clear understanding of the biogenesis pathways that lead to tsRNA accumulation, as well as of the array of biological processes they influence and their mechanism of action. Additionally, because of the widespread presence of RNA modifications in these molecules, the unbiased genome-wide quantification is not possible with the conventional sequencing technologies. Therefore, these molecules represent a largely uncharacterized stress-responsive regulatory network in plants, and thus an exciting source of potential applications for agriculture. The experimental approach of this project will use a model plant (Arabidopsis thaliana) in order to characterize the tsRNA population and evaluate the importance of this regulatory layer under viral stress. First, a method to compare the accumulation profiles of tsRNAs based on the enzymatic removal of RNA modifications will be implemented. Second, the biogenesis pathway of tRNA-derived sRNAs will be studied using mutant plants, and how this affects viral infection will be evaluated with these mutant plants. Third, the genes targeted by tRNA-derived sRNAs will be identified using a combined approach based on the immunoprecipitation of crosslinked AGO proteins and ribosome profiling that determines the translation rate. Overall, the data that this project would obtain has the potential to shift our understanding of tsRNAs and provide cutting-edge applications for agriculture. Thus, the completion of this project would provide me a considerable professional maturity.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

SVERIGES LANTBRUKSUNIVERSITET
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 206 887,68
Adresse
ALMAS ALLE 8
750 07 Uppsala
Schweden

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Region
Östra Sverige Östra Mellansverige Uppsala län
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0