Description du projet
Comprendre les mécanismes d’adaptation des plantes au froid extrême
Bien que le changement climatique soit plus souvent associé au réchauffement planétaire, il comprend également l’augmentation de la fréquence et de l’intensité des températures froides. Comprendre comment les plantes réagissent et s’adaptent aux périodes de froid extrême, à savoir les réseaux et mécanismes de régulation, sera essentiel pour la sécurité alimentaire mondiale, car nous ne disposons que de peu de connaissances à l’heure actuelle. Il est toutefois prouvé que les basses températures ont un effet direct sur l’accessibilité de la chromatine, qui à son tour affecte l’expression génétique. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet COOLCASE utilisera le système modèle végétal Arabidopsis thaliana pour étudier la dynamique du transcriptome codant et non codant, ainsi que les changements dans les sites accessibles de la chromatine en réponse à la baisse des températures.
Objectif
Plants, as sessile organisms, must constantly adapt to variable environmental conditions, among which temperature is of paramount importance in the context of climate change. Indeed, in future years, despite an expected rise in temperatures due to global warming, we can also expect an increase in the frequency of severe cold periods for which plants are not prepared. Therefore, understanding the molecular processes that allow plants to react and adapt to cold is essential for developing cold-resistant plants, which is ultimately indispensable for global food security. In recent decades many studies have embarked in addressing this issue. However, the global regulatory landscape underlying cold acclimation and adaption of plants to noisy and fluctuating natural cold conditions remain poorly investigated. Low temperatures are known to have a direct effect on chromatin accessibility which is directly linked to gene expression. Therefore, the aim of this project is to investigate the dynamics of the coding and non-coding Arabidopsis thaliana transcriptome, as well as changes in chromatin accessible sites, in response to regimes of decreasing temperatures. To this end, a comparative analysis of deep-coverage RNA-seq (transcriptome) and ATAC-seq (chromatin accessibility) will be performed on A. thaliana plants grown over weeks of fluctuating temperatures, mimicking natural cold conditions of autumn and early winter. The proposed experimental design will reveal novel coding genes, long non-coding RNAs (lncRNAs) and potential distal regulatory elements involved in Arabidopsis responses to cold. Thus, by combining interdisciplinary and mutually reinforcing approaches including (epi)genomics, (epi)genetics, transcriptomics and bioinformatics, the proposed project will significantly improve our understanding of the molecular mechanisms required for plant adaptation to cold temperatures likely delivering valuable tools for future breeding of cold resilient crop species.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé nutrition
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère climatologie changement climatique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
08193 CERDANYOLA DEL VALLES
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.