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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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MemoryRNA: the role of epitranscriptomics in thermomemory regulation

Description du projet

Comprendre les régulations du transcriptome des plantes lors des changements environnementaux

Les plantes s’adaptent constamment à des environnements en évolution, et le changement climatique intensifie ces contraintes. Les modifications de l’ARN jouent un rôle clé dans la régulation du comportement de l’ARN et contribuent à l’adaptation et à la survie des plantes. Il est essentiel pour l’agriculture moderne de comprendre comment les facteurs non génétiques influencent le transcriptome des plantes en cas de stress thermique. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MemoryRNA vise à identifier les modifications m5C et m6A à l’échelle du transcriptome qui contribuent aux réponses cellulaires au stress thermique, à caractériser ces marques sur les ARNm thermomémoriels et à étudier la régulation et la fonction de la protéine lectrice m6A ECT2 dans la régulation transcriptionnelle au niveau du méristème apical des pousses. Le projet s’appuiera sur des technologies de pointe pour valider et caractériser les ARNm contenant du m5C et du m6A.

Objectif

Plants live in constantly changing environments and the increased frequency of extreme weather, as a result of climate change, will exacerbate such stresses. The MemoryRNA project aims to expand the fundamental knowledge of non-genetically-based regulations of the plant transcriptome during heat stress (HS). Post-transcriptional modifications of RNA create an additional layer to reversibly control RNA fate. The sophisticated and poorly understood thermomemory phenomenon represents a powerful system to study the role of the RNA modifications and its high impact on RNA metabolism to reprogram the transcriptome, thus leading plants to adapt and survive. To unravel the role of epitranscriptomic-based reprogramming of the transcriptome of thermomemory RNAs at the shoot apical meristem, the project aims to: i) Reveal the m5C and m6A modifications transcriptome-wide that actively contribute to the global cellular response to HS; ii) Characterize the m5C and m6A marks on thermomemomery mRNAs; and iii) Determine how a m6A reader protein ECT2 is regulated upon HS, and its functional role on transcriptional regulation. Data and biological resources obtained by the team support the MemoryRNA project and incorporate a comprehensive set of cutting-edge technologies and approaches, including: i) Direct sequencing of long-read fragments and computational analysis for accurate mapping of RNA marks; ii) Antibody-based techniques and mutant plants to validate and characterise the function of m5C- and m6A-containing mRNAs; and iii) RNA and fluorescence in situ hybridization, and laser confocal microscopy to investigate the role of ECT2 during thermomemory. Understanding the mechanisms that coordinate transcriptional activity of HS-memory genes in response to environmental stressors is of utmost importance to modern agriculture, and throughout the the funding period, opportunities for translation of our results to biotechnological application will be monitored and explored.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -

Coordinateur

UNIVERSITAET POTSDAM
Contribution nette de l'UE
€ 173 847,36
Adresse
AM NEUEN PALAIS 10
14469 Potsdam
Allemagne

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Région
Brandenburg Brandenburg Potsdam
Type d’activité
Établissements d’enseignement supérieur ou secondaire
Liens
Coût total
Aucune donnée

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