Projektbeschreibung
Die Regulierung des pflanzlichen Transkriptoms bei Umweltveränderungen nachvollziehen
Pflanzen passen sich ständig an Umweltveränderungen an, wobei der Klimawandel diese Belastungen noch verstärkt. RNA-Modifikationen nehmen bei der Regulierung des RNA-Verhaltens eine Schlüsselrolle ein und unterstützen die Anpassung und das Überleben von Pflanzen. Für die moderne Landwirtschaft ist es unerlässlich zu verstehen, wie nicht-genetische Faktoren das pflanzliche Transkriptom bei Hitzestress beeinflussen. Ziel des über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts MemoryRNA ist es, transkriptomweite m5C- und m6A-Modifikationen zu ermitteln, die zu zellulären Reaktionen auf Hitzestress beitragen, diese Markierungen auf Thermomemory-mRNAs zu charakterisieren und die Regulierung und Funktion des m6A-Leserproteins ECT2 bei der Transkriptionsregulierung am Sprossapikalmeristem zu untersuchen. Das Projektteam wird fortgeschrittene Technologien zur Validierung und Charakterisierung von m5C- und m6A-haltigen mRNAs einsetzen.
Ziel
Plants live in constantly changing environments and the increased frequency of extreme weather, as a result of climate change, will exacerbate such stresses. The MemoryRNA project aims to expand the fundamental knowledge of non-genetically-based regulations of the plant transcriptome during heat stress (HS). Post-transcriptional modifications of RNA create an additional layer to reversibly control RNA fate. The sophisticated and poorly understood thermomemory phenomenon represents a powerful system to study the role of the RNA modifications and its high impact on RNA metabolism to reprogram the transcriptome, thus leading plants to adapt and survive. To unravel the role of epitranscriptomic-based reprogramming of the transcriptome of thermomemory RNAs at the shoot apical meristem, the project aims to: i) Reveal the m5C and m6A modifications transcriptome-wide that actively contribute to the global cellular response to HS; ii) Characterize the m5C and m6A marks on thermomemomery mRNAs; and iii) Determine how a m6A reader protein ECT2 is regulated upon HS, and its functional role on transcriptional regulation. Data and biological resources obtained by the team support the MemoryRNA project and incorporate a comprehensive set of cutting-edge technologies and approaches, including: i) Direct sequencing of long-read fragments and computational analysis for accurate mapping of RNA marks; ii) Antibody-based techniques and mutant plants to validate and characterise the function of m5C- and m6A-containing mRNAs; and iii) RNA and fluorescence in situ hybridization, and laser confocal microscopy to investigate the role of ECT2 during thermomemory. Understanding the mechanisms that coordinate transcriptional activity of HS-memory genes in response to environmental stressors is of utmost importance to modern agriculture, and throughout the the funding period, opportunities for translation of our results to biotechnological application will be monitored and explored.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenFinanzierungsplan
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordinator
14469 Potsdam
Deutschland