Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

MemoryRNA: the role of epitranscriptomics in thermomemory regulation

Opis projektu

Badanie regulacji transkryptomu roślin w wyniku zmian środowiskowych

Rośliny nieustannie dostosowują się do zmiennego środowiska, a zmiany klimatyczne nasilają występowanie stresów. Modyfikacje RNA odgrywają kluczową rolę w regulacji jego zachowania, wspomagając przystosowanie i przetrwanie roślin. Zrozumienie, w jaki sposób czynniki niegenetyczne wpływają na transkryptom roślin podczas stresu cieplnego ma kluczowe znaczenie dla nowoczesnego rolnictwa. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu MemoryRNA ma na celu zbadanie modyfikacji m5C i m6A w całym transkryptomie, które przyczyniają się do odpowiedzi komórkowej na stres cieplny. Ponadto badacze obrali za cel scharakteryzowanie tych śladów na mRNA pamięci termicznej oraz zbadanie regulacji i funkcji białka czytnika m6A nazywanego ECT2 w regulacji transkrypcji w merystemie wierzchołkowym pędu. Zespół wykorzysta zaawansowane technologie do zbadania i scharakteryzowania mRNA zawierającego modyfikacje m5C i m6A.

Cel

Plants live in constantly changing environments and the increased frequency of extreme weather, as a result of climate change, will exacerbate such stresses. The MemoryRNA project aims to expand the fundamental knowledge of non-genetically-based regulations of the plant transcriptome during heat stress (HS). Post-transcriptional modifications of RNA create an additional layer to reversibly control RNA fate. The sophisticated and poorly understood thermomemory phenomenon represents a powerful system to study the role of the RNA modifications and its high impact on RNA metabolism to reprogram the transcriptome, thus leading plants to adapt and survive. To unravel the role of epitranscriptomic-based reprogramming of the transcriptome of thermomemory RNAs at the shoot apical meristem, the project aims to: i) Reveal the m5C and m6A modifications transcriptome-wide that actively contribute to the global cellular response to HS; ii) Characterize the m5C and m6A marks on thermomemomery mRNAs; and iii) Determine how a m6A reader protein ECT2 is regulated upon HS, and its functional role on transcriptional regulation. Data and biological resources obtained by the team support the MemoryRNA project and incorporate a comprehensive set of cutting-edge technologies and approaches, including: i) Direct sequencing of long-read fragments and computational analysis for accurate mapping of RNA marks; ii) Antibody-based techniques and mutant plants to validate and characterise the function of m5C- and m6A-containing mRNAs; and iii) RNA and fluorescence in situ hybridization, and laser confocal microscopy to investigate the role of ECT2 during thermomemory. Understanding the mechanisms that coordinate transcriptional activity of HS-memory genes in response to environmental stressors is of utmost importance to modern agriculture, and throughout the the funding period, opportunities for translation of our results to biotechnological application will be monitored and explored.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSITAET POTSDAM
Wkład UE netto
€ 173 847,36
Koszt całkowity
Brak danych

Partnerzy (1)