Descrizione del progetto
Comprendere le regolazioni del trascrittoma delle piante durante i cambiamenti ambientali
Le piante si adattano costantemente ai cambiamenti dell’ambiente, e i cambiamenti climatici intensificano questi stress. Le modifiche dell’RNA svolgono un ruolo fondamentale nella regolazione del comportamento dell’RNA, poiché favoriscono l’adattamento e la sopravvivenza delle piante. Capire come i fattori non genetici influenzino il trascrittoma delle piante durante lo stress da calore è fondamentale per l’agricoltura moderna. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MemoryRNA si propone di identificare le modifiche m5C e m6A a livello di tutto il trascrittoma che contribuiscono alle risposte cellulari allo stress da calore, di definire le caratteristiche di questi marchi sugli mRNA con memoria termica e di studiare la regolazione e la funzione della proteina lettrice m6A ECT2 nella regolazione trascrizionale nel meristema apicale del germoglio. Il progetto sfrutterà tecnologie avanzate per convalidare e mRNA contenenti m5C e m6A e descriverne le caratteristiche.
Obiettivo
Plants live in constantly changing environments and the increased frequency of extreme weather, as a result of climate change, will exacerbate such stresses. The MemoryRNA project aims to expand the fundamental knowledge of non-genetically-based regulations of the plant transcriptome during heat stress (HS). Post-transcriptional modifications of RNA create an additional layer to reversibly control RNA fate. The sophisticated and poorly understood thermomemory phenomenon represents a powerful system to study the role of the RNA modifications and its high impact on RNA metabolism to reprogram the transcriptome, thus leading plants to adapt and survive. To unravel the role of epitranscriptomic-based reprogramming of the transcriptome of thermomemory RNAs at the shoot apical meristem, the project aims to: i) Reveal the m5C and m6A modifications transcriptome-wide that actively contribute to the global cellular response to HS; ii) Characterize the m5C and m6A marks on thermomemomery mRNAs; and iii) Determine how a m6A reader protein ECT2 is regulated upon HS, and its functional role on transcriptional regulation. Data and biological resources obtained by the team support the MemoryRNA project and incorporate a comprehensive set of cutting-edge technologies and approaches, including: i) Direct sequencing of long-read fragments and computational analysis for accurate mapping of RNA marks; ii) Antibody-based techniques and mutant plants to validate and characterise the function of m5C- and m6A-containing mRNAs; and iii) RNA and fluorescence in situ hybridization, and laser confocal microscopy to investigate the role of ECT2 during thermomemory. Understanding the mechanisms that coordinate transcriptional activity of HS-memory genes in response to environmental stressors is of utmost importance to modern agriculture, and throughout the the funding period, opportunities for translation of our results to biotechnological application will be monitored and explored.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
Vedi altri progetti per questo bandoMeccanismo di finanziamento
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinatore
14469 Potsdam
Germania