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Applying novel single-cell multiomics to elucidate leukaemia cell plasticity in resistance to targeted therapy

Descrizione del progetto

Combattere la farmacoresistenza nella LMA

La leucemia mieloide acuta (LMA) è un cancro letale con bassi tassi di sopravvivenza, per lo più dovuti alla farmacoresistenza. Nonostante i progressi delle terapie mirate, molti pazienti presentano una ricaduta. Una sfida fondamentale consiste nel capire come le alterazioni epigenetiche nella LMA consentano alle cellule tumorali di sviluppare resistenza sotto pressione farmacologica. Il progetto SC-Plasticity, finanziato dal CER, utilizzerà in tale ambito tecniche innovative di sequenziamento a singola cellula, come scRaCH-seq, per analizzare come le mutazioni dei regolatori epigenetici influenzino le risposte alla terapia. Studiando il modo in cui le modifiche epigenetiche influiscono sulla sensibilità ai farmaci, questa ricerca potrebbe aprire la strada a nuove strategie per superare la resistenza ai farmaci e migliorare i risultati del trattamento nella LMA.

Obiettivo

Novel targeted therapies are increasingly applied against a wide range of cancers. Although such agents can induce cures, most patients suffer from relapsed disease.

Acute myeloid leukaemia (AML) is a prime example of a deadly disease, but we have a chance to dramatically improve outcomes if we can better understand resistance mechanisms against targeted agents that are transforming AML treatment, such as the BCL2 inhibitor venetoclax. AML is characterised by profound alterations in the epigenome that are correlated with poor survival. I therefore hypothesise that targeted drug pressure induces epigenetic plasticity that allows cancer cells to sample alternate chromatin or transcriptional states, a subset of which confer drug resistance. A major challenge is to define how mutations of epigenetic regulators in AML affect therapy responses due to clonal heterogeneity. To address this challenge, I will use and further develop my recently published single-cell Rapid Capture Hybridization sequencing (scRaCH-seq) method to link the genotype of expressed genes to transcription and methylation profiles of thousands of single cells. In this research proposal, I aim to (1) develop a new method linking epigenetic landscape, genotype and transcriptome at a single-cell level and define the impact of treatment on these interactions. (2) Analyse the genome-wide impact of epigenetic therapies. (3) Define the association between drug sensitivity and epigenetic modifications regulating pro-survival genes. To achieve my goals, I will apply my novel single-cell multiomics to samples from AML patients treated with venetoclax alone or in combination with epigenetic therapies and apply state-of-the-art technologies to established laboratory models.

Our new approaches to fully understand the relationship between the genome, epigenome and transcriptome will advance fundamental biology. This has the potential to yield new therapeutic strategies to prevent and overcome resistance.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2023-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

STICHTING AMSTERDAM UMC
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 882 440,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 882 440,00

Beneficiari (1)

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