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Tuning TDP-43 self-assembly to understand physiological function and dysfunction

Descrizione del progetto

Chiarire la disfunzione delle proteine che legano l’RNA in condizioni di malattia

Le proteine che legano l’RNA, essenziali per l’espressione genica, riconoscono centinaia di trascritti e formano ampie reti di regolazione; in caso di disfunzione, ne deriva l’insorgenza di numerose malattie, tra cui i disturbi neurodegenerativi. Il progetto TDP-Assembly, finanziato dal CER, si concentrerà sui meccanismi molecolari che determinano la disfunzione della proteina TDP-43 che lega l’RNA, alla base di diverse patologie neurodegenerative. In particolare, TDP-43 può presentare un processo di autoassemblaggio aberrante da cui possono derivare errori nell’elaborazione dell’RNA. TDP-Assembly si avvarrà di approcci di biologia molecolare e sintetica al fine di manipolare l’autoassemblaggio di TDP-43 nelle cellule e di studiare il modo in cui ciò influisce sulle funzioni essenziali di tale proteina. La mappatura di vari processi e funzioni di autoassemblaggio potrebbe chiarire il ruolo svolto dall’autoassemblaggio aberrante nelle malattie neurodegenerative.

Obiettivo

Neurodegenerative disorders are an enormous societal burden and we lack therapies that target these diseases at their origins. To develop therapies, we need to understand what goes wrong at the molecular level. I uncovered key mechanisms that cause RNA-binding proteins, such as TDP-43, to dysfunction and drive neurodegenerative processes. I discovered that RNA-binding proteins self-assemble into ribonucleoprotein granules that are the likely origins of RNA-binding protein aggregates. More recently, my group and I revealed aberrant phase transitions of condensed RNA-binding proteins occurring in disease and identified fundamental mechanisms by which such phase transitions are regulated in cells.
In TDP-Assembly, I now want to find out why these proteins exhibit a self-assembly behavior that apparently risks pathological aggregation. My hypothesis is that self-assembly is essential for their many functions in gene regulation, and that different types of self-assemblies, e.g. small clusters or fluid or solid condensates, mediate different functions in cells. Using TDP-43 as a paradigm, I will test this hypothesis to ultimately understand the molecular basis of RNA-binding protein dysfunction in neurodegeneration.
To achieve this goal, I will use synthetic biology approaches to rationally tune self-assembly of TDP-43 in cells. I will study how altered TDP-43 self-assembly affects its known molecular functions, i.e. regulation of transcription, alternative splicing, and translation. Transcriptome and proteome analyses will draw a systems biology map of altered TDP-43 self-assembly and might lead us to novel functions of TDP-43 self-assembly. Ultimately, I will address how TDP-43's self-assembly, and thus its functions, are altered by disease-linked mutations in neuronal cells.
TDP-Assembly will forge a new understanding of the functional and pathological relevance of RNA-binding protein self-assembly and might inspire new therapies that target self-assembly processes.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2023-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

JOHANNES GUTENBERG-UNIVERSITAT MAINZ
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 919 989,00
Indirizzo
SAARSTRASSE 21
55122 MAINZ
Germania

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Regione
Rheinland-Pfalz Rheinhessen-Pfalz Mainz, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 999 989,00

Beneficiari (2)

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