SWEEPICS: SWEPT LASERS FOR NON-INVASIVE DIAGNOSTICS

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Veröffentlichungen

Probe set selection for targeted spatial transcriptomics

Autoren: Louis B. Kuemmerle, Malte D. Luecken, Alexandra B. Firsova, Lisa Barros de Andrade e Sousa, Lena Straßer, Ilhem Isra Mekki, Francesco Campi, Lukas Heumos, Maiia Shulman, Valentina Beliaeva, Soroor Hediyeh-Zadeh, Anna C. Schaar, Krishnaa T. Mahbubani, Alexandros Sountoulidis, Tamás Balassa, Ferenc Kovacs, Peter Horvath, Marie Piraud, Ali Ertürk, Christos Samakovlis, Fabian J. Theis
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 21, 2025, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41592-024-02496-Z

Single-cell light-sheet fluorescence 3D images of tumour-stroma spheroid multicultures

Autoren: Akos Diosdi, Filippo Piccinini, Timea Boroczky, Gabriella Dobra, Gastone Castellani, Krisztina Buzas, Peter Horvath, Maria Harmati
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 12, 2025, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-025-04832-0

Molecular Systems Biology

Autoren: Peter Horvath; Fabian Coscia
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, 2025, ISSN 1744-4292
Herausgeber: EMBO Press & Wiley-VCH
DOI: 10.1038/S44320-025-00101-9

Synergistic integration of materials in medical microrobots for advanced imaging and actuation

Autoren: Paul Wrede; Eva Remlova; Yi Chen; Xosé Luís Deán-Ben; Metin Sitti; Daniel Razansky
Veröffentlicht in: Nature Reviews Materials, 2025, ISSN 2058-8437
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/S41578-025-00811-4

Optics Express

Autoren: Tonio F. Kutscher; Christian Stock; Florian Sommer; Jonas Jurkevicius; Stefan Meyer; Moritz Wiggert; Philipp Lamminger; Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: Optics Express, 2025, ISSN 1094-4087
Herausgeber: Optical Society of America
DOI: 10.1364/OE.541976

SuperCUT, an unsupervised multimodal image registration with deep learning for biomedical microscopy

Autoren: Istvan Grexa, Zsanett Zsófia Iván, Ede Migh, Ferenc Kovács, Hella A Bolck, Xiang Zheng, Andreas Mund, Nikita Moshkov, Vivien Miczán, Krisztian Koos, Peter Horvath
Veröffentlicht in: Briefings in Bioinformatics, Ausgabe 25, 2024, ISSN 1467-5463
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIB/BBAE029

HCS-3DX, a next-generation AI-driven automated 3D-oid high-content screening system

Autoren: Akos Diosdi, Timea Toth, Maria Harmati, Grexa Istvan, Bálint Schrettner, Nora Hapek, Ferenc Kovacs, Andras Kriston, Krisztina Buzas, Francesco Pampaloni, Filippo Piccinini, Peter Horvath
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-63955-5

Learning representations for image-based profiling of perturbations

Autoren: Nikita Moshkov, Michael Bornholdt, Santiago Benoit, Matthew Smith, Claire McQuin, Allen Goodman, Rebecca A. Senft, Yu Han, Mehrtash Babadi, Peter Horvath, Beth A. Cimini, Anne E. Carpenter, Shantanu Singh, Juan C. Caicedo
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-024-45999-1

Spatial proteomics in translational and clinical research

Autoren: Peter Horvath, Fabian Coscia
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 21, 2025, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44320-025-00101-9

Optics Express

Autoren: Tonio F. Kutscher; Christian Stock; Florian Sommer; Jonas Jurkevicius; Stefan Meyer; Moritz Wiggert; Philipp Lamminger; Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: Optics Express, 2025, ISSN 1094-4087
Herausgeber: Optica
DOI: 10.1364/OE.541976

Scientific Reports

Autoren: Sundar, Shruti; Jin, Tian; id_orcid0000-0002-4358-3184; Liu, Yu-Hang; Chen, Zhenyue; Reiss, Michael; Kurnikov, Alexey; Subochev, Pavel; Razansky, Daniel; id_orcid0000-0001-8676-0964
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.3929/ETHZ-B-000744284

Coordinated Two‐Photon Fluorescence and Optoacoustic Microscopy of Neural, Vascular, and Cellular Dynamics in the Mouse Brain

Autoren: Tian Jin, Shruti Sundar, Yu‐Hang Liu, Chaim Glück, Quanyu Zhou, Zhenyue Chen, Michael Reiss, Lin Tang, Bruno Weber, Daniel Razansky
Veröffentlicht in: Laser & Photonics Reviews, Ausgabe 19, 2025, ISSN 1863-8880
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/LPOR.202500102

Establishment of an imaging-based screening pipeline for the identification of human ribosome biogenesis inhibitors

Autoren: Claudia Gafko, Réka Hollandi, Kerstin Dörner, Matteo Rosellini, Ivo Zemp, Peter Horvath, Ulrike Kutay
Veröffentlicht in: BMC Biology, Ausgabe 23, 2025, ISSN 1741-7007
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S12915-025-02425-2

Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung

Autoren: Alexandra B. Firsova, Sergio Marco Salas, Louis B. Kuemmerle, Xesús M. Abalo, Alexandros Sountoulidis, Ludvig Larsson, Krishnaa T. Mahbubani, Jonas Theelke, Zaneta Andrusivova, Leire Alonso Galicia, Andreas Liontos, Tamás Balassa, Ferenc Kovacs, Peter Horvath, Yuexin Chen, Janine Gote-Schniering, Mircea-Gabriel Stoleriu, Jürgen Behr, Kerstin B. Meyer, Wim Timens, Herbert B. Schiller, Malte D. Luecken, Fabian J. Theis, Joakim Lundeberg, Mats Nilsson, Martijn C. Nawijn, Christos Samakovlis
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-65704-0

976 nm Swept-Source FDML-MOPA Laser for Multiphoton Microscopy

Autoren: Stefan Meyer, Tonio Kutscher, Kimberley Goodwin, Jan Wenzel, Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: 2025 Conference on Lasers and Electro-Optics Europe &amp; European Quantum Electronics Conference (CLEO/Europe-EQEC), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/CLEO/EUROPE-EQEC65582.2025.11109978

Virtual Histology of Brain Aspirate Using Kilohertz Two-Photon SLIDE Microscopy

Autoren: Gregory Berg, Matthea Thielking, Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.M5C.5

Label Free 775nm SLIDE Autofluorescence Images of NADH and FAD

Autoren: Tonio F. Kutscher, Christian Stock, Florian Sommer, Jonas Jurkevicius, Stefan Meyer, Philipp Lamminger, Stefanie Köhler, Moritz Wiggert, Sebastian ‘Nino’ Karpf
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.M5C.3

Tomographic Flow Cytometry of Organoids using Ultra-Fast 3D Two-Photon SLIDE Microscopy

Autoren: Matthea Thielking, Gregory Berg, Christian Stock, Florian Sommer, Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.M4C.1

SLIDE Multiphoton Microscopy of Green Fluorescent Dyes with 640 frames per second

Autoren: Stefan Meyer, Kimberley Goodwin, Tonio Kutscher, Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.S1A.4

Kilohertz Fluorescence Imaging Flow Cytometry

Autoren: Christian Stock, Matthea Thielking, Sebastian Karpf
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.S4C.2

On Site Brain Tumour Detection Using Flow Histology via High Speed Multiphoton SLIDE Microscopy during Ultrasonic Tissue Dissection

Autoren: Theisen-Kunde Dirk, Thielking Matthea, Berg Gregory, Kren Jessica, E. Neumann Julia, Bonsanto Matteo Mario, Karpf Sebastian
Veröffentlicht in: European Conferences on Biomedical Optics 2025, 2025
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/ECBO.2025.TU3A.2

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