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Causes and consequences of aberrant mRNA translation in cancer

Projektbeschreibung

Anomale Proteinsynthese und Krebsprogression

Werden T-Zellen als Reaktion auf Krebs aktiviert, setzen sie Interferon-γ frei, das die Umwandlung von Tryptophan in Kynurenin auslöst. Kynurenin trägt zwar dazu bei, die Aktivität der T-Zellen gegen den Tumor zu unterdrücken, aber mit seiner Erzeugung wird auch die Verfügbarkeit von Tryptophan für die Tumorzellen selbst verringert. Das führt häufig zu Fehlern in der Proteinsynthese und zur Erzeugung anomaler Proteine, die Tumorwachstum und Metastasierung fördern können. Das Team des ERC-finanzierten Projekts pepTalks zielt darauf ab, die Auswirkungen einer aberranten mRNA-Translation bei Krebs zu untersuchen sowie innovative therapeutische Strategien zu entwickeln, die diese Prozesse ins Visier nehmen.

Ziel

Shortages in amino acids are weapons in the warfare between tumor cells and tumor-infiltrating lymphocytes. Tumor cells enhance or inhibit the production of key amino acid metabolites to stimulate oncogenesis and suppress anti-tumor activity. A key player in this battle is tryptophan. Activated T cells secrete interferon-, which upregulates IDO1 enzyme to catabolize tryptophan to kynurenine in target tumor cells. While kynurenine suppresses T-cell function, its production limits tryptophan availability in tumor cells. Importantly, as tumor cells almost invariably deregulate mRNA translation to promote proliferation and metastasis, the consequences of tryptophan shortage are major. It provokes aberrant mRNA translation at tryptophan codons, resulting in ribosomal frameshifting and tryptophan to phenylalanine (W>F) codon reassignments (substitutants). This aberrant mRNA translation alters protein function and enriches the landscape of neoepitopes at the surface of tumor cells. Based on these observations, I hypothesize here that the detection of aberrant proteins in cancer specimens can reveal additional key processes of cancer progression beyond tryptophan that can be utilized for cancer therapy.

To explore this exciting new idea, I designed three work packages (WPs):
WP1 will expand the landscape of aberrant mRNA translation in cancer and link them to cancerous events. Preliminary results pinpoint arginine, histidine, and leucine.
WP2 will generate reporter assays, set up functional genetic screens, and identify, validate, and explore key regulators of aberrant mRNA translation.
WP3 will study the functional consequences of aberrant mRNA translation, and introduce novel therapeutic concepts.
Altogether, this proposal will employ our recent discoveries of aberrant mRNA translation during periods of amino acid shortages to explore novel interplays between cancers and their suppressive microenvironment, and utilize this new knowledge for cancer therapy.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Programm/Programme

Gastgebende Einrichtung

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netto-EU-Beitrag
€ 2 500 000,00
Gesamtkosten
€ 2 500 000,00

Begünstigte (1)