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Dissecting host-transposon interactions during germline development and their impact on genome integrity

Descrizione del progetto

In che modo le cellule germinali proteggono il genoma dagli elementi trasponibili

Gli elementi trasponibili (TE) sono una parte naturale dei genomi dei mammiferi, ma quando vengono attivati possono alterare la stabilità del genoma stesso. Durante lo sviluppo fetale, la metilazione del DNA, che di solito mantiene silenti i TE, viene persa. Questo porta alla potenziale riattivazione dei TE, che potrebbe causare danni genetici. Non è ancora chiaro come le cellule germinali fetali, note come prospermatogoni, affrontino questa sfida. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, TE-Time risponderà a questa domanda. In particolare, studiando i modelli di attività genica e l’organizzazione tridimensionale del genoma, i ricercatori sperano di scoprire nuove conoscenze sulla regolazione dei TE, con potenziali applicazioni per l’infertilità, il cancro e altre malattie.

Obiettivo

Mammalian genomes are filled with transposable elements (TEs), whose activity is usually silenced by DNA methylation. However, during the fetal phase of germline development, DNA methylation is naturally lost as part of the epigenetic reprogramming of the future gametes. This leads to the transcriptional activation of transposition-competent TEs, which normally represents a threat to genomic integrity and species fitness. How fetal male germ cells (a.k.a. prospermatogonia) mechanistically cope with TE reactivation and protect the integrity of the genetic material?

Preliminary data from the lab indicates that TEs acquire both permissive H3K4me3 and repressive H3K9me3 marks in mouse prospermatogonia, and may be subject to early transcription termination. I will investigate whether these regulatory patterns may allow prospermatogonia to tolerate active TEs and even integrate them into their own developmental program. Focusing on this unique cellular model provided by prospermatogonia, I will 1) assess the dynamics of H3K4me3-K9me3 marks using single cell multimodal chromatin profiling in relation to prospermatogonia development, 2) analyze TE transcriptional features, 3) study the 3D coordination of TE regulation within the nucleus and 4) investigate whether TEs participate to the prospermatogonia gene expression program by providing regulatory sequences. I believe this project will identify novel principles in TE regulation with immediate relevance for the field of reproductive biology. Knowledge will be gained regarding the origin of infertilities, but also for other pathological contexts such as cancer and neurodegenerative diseases, whereby DNA methylation loss and TE reactivation are commonly observed.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

INSTITUT CURIE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 195 914,88
Indirizzo
RUE D ULM 26
75231 Paris
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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