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Clonal dynamics and mitochondrial dysfunction in hematopoiesis following chemotherapy

Projektbeschreibung

Die Auswirkungen der Chemotherapie auf das Blut von jungen Menschen, die Krebs überlebt haben

Die Chemotherapie visiert sich teilende Krebszellen an und hemmt deren Wachstum und Vermehrung. Sie beeinträchtigt allerdings ebenso normale Zellen wie die des blutbildenden Systems, was zu einer Schädigung des Knochenmarks führt und das Risiko für Infektionen und Blutungen erhöht. Ziel des über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts CYNAMIS ist es, die Auswirkungen der Chemotherapie auf die klonale Dynamik der Hämatopoese, die mitochondriale Dysfunktion und die genetische Integrität zu untersuchen. Die Forschenden werden Einzelzell-Multiomik-Verfahren bei jungen Menschen, die Krebs überlebt haben, anwenden und die mitochondriale und nukleare DNS auf Mutationen, Methylierung und Chromatinstatus analysieren. Die Projektergebnisse sollen dazu beitragen, Mechanismen der beschleunigten Alterung und der mitochondrialen Dysfunktion zu ermitteln, um so die klinischen Ergebnisse bei Krebserkrankten zu verbessern.

Ziel

Chemotherapy can cause significant damage to healthy tissues, especially in the hematopoietic system. As a result, cancer survivors may experience bone marrow damage manifested as cytopenias, which increase the risk of infections and bleeding. Despite this, there has not been a thorough examination of these events, including the clonal dynamics of hematopoiesis after chemotherapy exposure, due to a lack of methodologies to perform lineage tracing in humans in vivo. To address this, I will study the effects of chemotherapy on the clonal dynamics of hematopoiesis, mitochondrial dysfunction and genetic integrity in young cancer survivors. I will analyze samples obtained before, during, and after treatment using emerging single-cell multi-omic approaches to effectively capture mitochondrial DNA (mtDNA) genetic variation for inferences of clonal dynamics and studies of mtDNA damage. By combining mtDNA-based clonal inferences with whole-genome sequencing (WGS)-based detection of somatic nuclear DNA mutations, I will provide deep phylogenies with scalable single-cell resolved clonal measurements of perturbed hematopoiesis following chemotherapy. Moreover, orthogonal analysis of DNA methylation and chromatin accessibility data will yield new molecular insights into chemotherapy-induced accelerated aging and mitochondrial dysfunction (a hallmark of aging). This project sets out to gain quantitative and fundamental insights into the long-term molecular defects of chemotherapy in young cancer survivors, potentially paving the way for new interventions to improve the quality of life of this emergent population.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Finanzierungsplan

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -

Koordinator

CHARITE - UNIVERSITAETSMEDIZIN BERLIN
Netto-EU-Beitrag
€ 189 687,36
Adresse
Chariteplatz 1
10117 Berlin
Deutschland

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Region
Berlin Berlin Berlin
Aktivitätstyp
Mittlere und höhere Bildungseinrichtungen
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Gesamtkosten
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