Bringing Intrinsically Disordered Proteins to Biomedical Applications

Informations projet

IDP2Biomed

N° de convention de subvention: 101160233

DOI

10.3030/101160233

Date de signature de la CE 9 Mai 2024

Date de début 1 Octobre 2024

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• Widening participation and spreading excellence

Coût total

Aucune donnée

Contribution de l’UE

€ 1 244 706,00

Coordonné par

EOTVOS LORAND TUDOMANYEGYETEM
Hungary

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Websites, patent fillings, videos etc. (2)

Launch of the IDP2Biomed HUB
Launch of the IDP2Biomed website and links to social media, Communication toolkit

Launch of the IDP2Biomed website and links to social media, communication toolkit

Documents, reports (2)

Detailed Dissemination, Communication, Outreach and Exploitation Plan (DCOP) (Lead: ELTE)
Report on state-of-the art of characterizing conformational states of IDPs

Publications

Peer reviewed articles (12)

AIUPred - Binding: energy embedding to identify disordered binding regions

Auteurs: Gábor Erdős, Norbert Deutsch, Zsuzsanna Dosztányi
Publié dans: Journal of Molecular Biology, 2025, ISSN 0022-2836
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JMB.2025.169071

Towards a Unified Framework for Determining Conformational Ensembles of Disordered Proteins

Auteurs: Hamidreza Ghafouri, Pavel Kadeřávek, Ana M Melo, Maria Cristina Aspromonte, Pau Bernadó, Juan Cortes, Zsuzsanna Dosztányi, Gabor Erdos, Michael Feig, Giacomo Janson, Kresten Lindorff-Larsen, Frans A. A. Mulder, Peter Nagy, Richard Pestell, Damiano Piovesa
Publié dans: arXiv, 2025, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.03590

DisProt in 2026: enhancing intrinsically disordered proteins accessibility, deposition, and annotation

Auteurs: Maria Victoria Nugnes, Kamel Eddine Adel Bouhraoua, Mehdi Zoubiri, Rita Pancsa, Erzsébet Fichó, null null, Alexander M Monzon, Ana M Melo, Edoardo Salladini, Emanuela Leonardi, Federica Quaglia, Daniyal Nasiribavil, Hamidreza Ghafouri, Gobeill Julien, Emilie Pasche, Patrick Ruch, Paul Van Rijen, László Dobson, Marco Schiavina, Trinidad Cordero, Zsófia E Kálmán, Ximena Castro, Valentín Iglesias, István Reményi, Mahta Mehdiabadi, Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi, Peter Tompa, Damiano Piovesan, Silvio C E Tosatto, Maria Cristina Aspromonte
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 54, 2026, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF1175

Selective engineering of condensation properties of single-stranded DNA binding (SSB) protein via its intrinsically disordered linker region

Auteurs: Péter Ecsédi; Dávid Érfalvy; Zoltán J Kovács; Viktoria Katran; János Pálinkás; Miklós Cervenak; Rita Pancsa; Gábor M Harami; László Smeller; Mihály Kovács
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAF481

Fine‐tuned interactions between globular and disordered regions of single‐stranded <scp>DNA</scp> binding (<scp>SSB</scp>) protein are required for dynamic condensation under physiological conditions

Auteurs: Zoltán J. Kovács; Péter Ecsédi; Gábor M. Harami; János Pálinkás; Mina Botros; Lamiya Mahmudova; Viktoria Katran; Dávid Érfalvy; Miklós Cervenak; László Smeller; Mihály Kovács
Publié dans: Protein Science, 2025, ISSN 1613-6829
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/PRO.70109

<scp>DR</scp> and <scp>SPIT</scp>: Statistical approaches for identifying transient structure in intrinsically disordered proteins via <scp>NMR</scp> chemical shifts

Auteurs: Dániel Kovács; Andrea Bodor
Publié dans: Protein Science, 2025, ISSN 1469-896X
Éditeur: Wiley-Blackwel
DOI: 10.1002/PRO.70250

MOBIDB in 2025: integrating ensemble properties and function annotations for intrinsically disordered proteins

Auteurs: Damiano Piovesan; Alessio Del Conte; Mahta Mehdiabadi; Maria Cristina Aspromonte; Matthias Blum; Giulio Tesei; Sören von Bülow; Kresten Lindorff-Larsen; Silvio C E Tosatto
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE969

Phase transition drives bacterial single-stranded DNA binding (SSB) protein mobilization during stress response and metabolic adaptation

Auteurs: Péter Ecsédi1 , Júlia Szittyai1 , János Pálinkás1,2, Bálint Jezsó1,2, Viktoria Katran1 , Zoltán J. Kovács1,2, Henriett Halász3 , Tasvilla Sonallya4 , Tünde Juhász4 , Tamás Beke-Somfai4 , Szilvia Barkó3 , Edina Szabó-Meleg3 , and Mihály Kovács1,2
Publié dans: bioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.28.672810V1

DRMAAtic: dramatically improve your cluster potential

Auteurs: Del Conte, Alessio; Ghafouri, Hamidreza; Clementel, Damiano; Mičetić, Ivan; Piovesan, Damiano; Tosatto, Silvio C E; Monzon, Alexander Miguel
Publié dans: Bioinformatics Advances, 2024, ISSN 2635-0041
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF112

GeomeTRe: accurate calculation of geometrical descriptors of tandem repeat proteins

Auteurs: Osmanli, Zarifa; Ferrero, Elisa; Monzon, Alexander Miguel; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano
Publié dans: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF395

Deep learning for intrinsically disordered proteins: From improved predictions to deciphering conformational ensembles

Auteurs: Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 89, 2024, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102950

Critical Assessment of Protein Intrinsic Disorder Round 3 ‐ Predicting Disorder in the Era of Protein Language Models

Auteurs: Mahta Mehdiabadi, Alessio Del Conte, Maria Victoria Nugnes, Maria Cristina Aspromonte, Silvio C. E. Tosatto, Damiano Piovesan
Publié dans: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/PROT.70045