Bringing Intrinsically Disordered Proteins to Biomedical Applications

Informations projet

IDP2Biomed

N° de convention de subvention: 101160233

DOI

10.3030/101160233

Date de signature de la CE 9 Mai 2024

Date de début 1 Octobre 2024

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• Widening participation and spreading excellence

Coût total

Aucune donnée

Contribution de l’UE

€ 1 244 706,00

Coordonné par

EOTVOS LORAND TUDOMANYEGYETEM
Hungary

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Publications

Peer reviewed articles (10)

AIUPred - Binding: energy embedding to identify disordered binding regions

Auteurs: Gábor Erdős, Norbert Deutsch, Zsuzsanna Dosztányi
Publié dans: Journal of Molecular Biology, 2025, ISSN 0022-2836
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JMB.2025.169071

Towards a Unified Framework for Determining Conformational Ensembles of Disordered Proteins

Auteurs: Hamidreza Ghafouri, Pavel Kadeřávek, Ana M Melo, Maria Cristina Aspromonte, Pau Bernadó, Juan Cortes, Zsuzsanna Dosztányi, Gabor Erdos, Michael Feig, Giacomo Janson, Kresten Lindorff-Larsen, Frans A. A. Mulder, Peter Nagy, Richard Pestell, Damiano Piovesa
Publié dans: arXiv, 2025, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.03590

Selective engineering of condensation properties of single-stranded DNA binding (SSB) protein via its intrinsically disordered linker region

Auteurs: Péter Ecsédi; Dávid Érfalvy; Zoltán J Kovács; Viktoria Katran; János Pálinkás; Miklós Cervenak; Rita Pancsa; Gábor M Harami; László Smeller; Mihály Kovács
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAF481

Fine‐tuned interactions between globular and disordered regions of single‐stranded <scp>DNA</scp> binding (<scp>SSB</scp>) protein are required for dynamic condensation under physiological conditions

Auteurs: Zoltán J. Kovács; Péter Ecsédi; Gábor M. Harami; János Pálinkás; Mina Botros; Lamiya Mahmudova; Viktoria Katran; Dávid Érfalvy; Miklós Cervenak; László Smeller; Mihály Kovács
Publié dans: Protein Science, 2025, ISSN 1613-6829
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/PRO.70109

<scp>DR</scp> and <scp>SPIT</scp>: Statistical approaches for identifying transient structure in intrinsically disordered proteins via <scp>NMR</scp> chemical shifts

Auteurs: Dániel Kovács; Andrea Bodor
Publié dans: Protein Science, 2025, ISSN 1469-896X
Éditeur: Wiley-Blackwel
DOI: 10.1002/PRO.70250

MOBIDB in 2025: integrating ensemble properties and function annotations for intrinsically disordered proteins

Auteurs: Damiano Piovesan; Alessio Del Conte; Mahta Mehdiabadi; Maria Cristina Aspromonte; Matthias Blum; Giulio Tesei; Sören von Bülow; Kresten Lindorff-Larsen; Silvio C E Tosatto
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE969

DRMAAtic: dramatically improve your cluster potential

Auteurs: Del Conte, Alessio; Ghafouri, Hamidreza; Clementel, Damiano; Mičetić, Ivan; Piovesan, Damiano; Tosatto, Silvio C E; Monzon, Alexander Miguel
Publié dans: Bioinformatics Advances, 2024, ISSN 2635-0041
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF112

GeomeTRe: accurate calculation of geometrical descriptors of tandem repeat proteins

Auteurs: Osmanli, Zarifa; Ferrero, Elisa; Monzon, Alexander Miguel; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano
Publié dans: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF395

Deep learning for intrinsically disordered proteins: From improved predictions to deciphering conformational ensembles

Auteurs: Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 89, 2024, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102950

Critical Assessment of Protein Intrinsic Disorder Round 3 ‐ Predicting Disorder in the Era of Protein Language Models

Auteurs: Mahta Mehdiabadi, Alessio Del Conte, Maria Victoria Nugnes, Maria Cristina Aspromonte, Silvio C. E. Tosatto, Damiano Piovesan
Publié dans: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/PROT.70045