Bringing Intrinsically Disordered Proteins to Biomedical Applications

Informazioni relative al progetto

IDP2Biomed

ID dell’accordo di sovvenzione: 101160233

DOI

10.3030/101160233

Data della firma CE 9 Maggio 2024

Data di avvio 1 Ottobre 2024

Data di completamento 30 Settembre 2027

Finanziato da

• Widening participation and spreading excellence

Costo totale

Nessun dato

Contributo UE

€ 1 244 706,00

Coordinato da

EOTVOS LORAND TUDOMANYEGYETEM
Hungary

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (10)

AIUPred - Binding: energy embedding to identify disordered binding regions

Autori: Gábor Erdős, Norbert Deutsch, Zsuzsanna Dosztányi
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, 2025, ISSN 0022-2836
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JMB.2025.169071

Towards a Unified Framework for Determining Conformational Ensembles of Disordered Proteins

Autori: Hamidreza Ghafouri, Pavel Kadeřávek, Ana M Melo, Maria Cristina Aspromonte, Pau Bernadó, Juan Cortes, Zsuzsanna Dosztányi, Gabor Erdos, Michael Feig, Giacomo Janson, Kresten Lindorff-Larsen, Frans A. A. Mulder, Peter Nagy, Richard Pestell, Damiano Piovesa
Pubblicato in: arXiv, 2025, ISSN 2331-8422
Editore: Cornell University
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.03590

Selective engineering of condensation properties of single-stranded DNA binding (SSB) protein via its intrinsically disordered linker region

Autori: Péter Ecsédi; Dávid Érfalvy; Zoltán J Kovács; Viktoria Katran; János Pálinkás; Miklós Cervenak; Rita Pancsa; Gábor M Harami; László Smeller; Mihály Kovács
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAF481

Fine‐tuned interactions between globular and disordered regions of single‐stranded <scp>DNA</scp> binding (<scp>SSB</scp>) protein are required for dynamic condensation under physiological conditions

Autori: Zoltán J. Kovács; Péter Ecsédi; Gábor M. Harami; János Pálinkás; Mina Botros; Lamiya Mahmudova; Viktoria Katran; Dávid Érfalvy; Miklós Cervenak; László Smeller; Mihály Kovács
Pubblicato in: Protein Science, 2025, ISSN 1613-6829
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/PRO.70109

<scp>DR</scp> and <scp>SPIT</scp>: Statistical approaches for identifying transient structure in intrinsically disordered proteins via <scp>NMR</scp> chemical shifts

Autori: Dániel Kovács; Andrea Bodor
Pubblicato in: Protein Science, 2025, ISSN 1469-896X
Editore: Wiley-Blackwel
DOI: 10.1002/PRO.70250

MOBIDB in 2025: integrating ensemble properties and function annotations for intrinsically disordered proteins

Autori: Damiano Piovesan; Alessio Del Conte; Mahta Mehdiabadi; Maria Cristina Aspromonte; Matthias Blum; Giulio Tesei; Sören von Bülow; Kresten Lindorff-Larsen; Silvio C E Tosatto
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE969

DRMAAtic: dramatically improve your cluster potential

Autori: Del Conte, Alessio; Ghafouri, Hamidreza; Clementel, Damiano; Mičetić, Ivan; Piovesan, Damiano; Tosatto, Silvio C E; Monzon, Alexander Miguel
Pubblicato in: Bioinformatics Advances, 2024, ISSN 2635-0041
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF112

GeomeTRe: accurate calculation of geometrical descriptors of tandem repeat proteins

Autori: Osmanli, Zarifa; Ferrero, Elisa; Monzon, Alexander Miguel; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano
Pubblicato in: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Editore: Oxford Academic
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF395

Deep learning for intrinsically disordered proteins: From improved predictions to deciphering conformational ensembles

Autori: Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 89, 2024, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102950

Critical Assessment of Protein Intrinsic Disorder Round 3 ‐ Predicting Disorder in the Era of Protein Language Models

Autori: Mahta Mehdiabadi, Alessio Del Conte, Maria Victoria Nugnes, Maria Cristina Aspromonte, Silvio C. E. Tosatto, Damiano Piovesan
Pubblicato in: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/PROT.70045