Bringing Intrinsically Disordered Proteins to Biomedical Applications

Projektinformationen

IDP2Biomed

ID Finanzhilfevereinbarung: 101160233

DOI

10.3030/101160233

EK-Unterschriftsdatum 9 Mai 2024

Startdatum 1 Oktober 2024

Enddatum 30 September 2027

Finanziert unter

• Widening participation and spreading excellence

Gesamtkosten

Keine Daten

EU-Beitrag

€ 1 244 706,00

Koordiniert durch

EOTVOS LORAND TUDOMANYEGYETEM
Hungary

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Websites, patent fillings, videos etc. (2)

Launch of the IDP2Biomed HUB
Launch of the IDP2Biomed website and links to social media, Communication toolkit

Launch of the IDP2Biomed website and links to social media, communication toolkit

Documents, reports (2)

Detailed Dissemination, Communication, Outreach and Exploitation Plan (DCOP) (Lead: ELTE)
Report on state-of-the art of characterizing conformational states of IDPs

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (12)

AIUPred - Binding: energy embedding to identify disordered binding regions

Autoren: Gábor Erdős, Norbert Deutsch, Zsuzsanna Dosztányi
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Biology, 2025, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JMB.2025.169071

Towards a Unified Framework for Determining Conformational Ensembles of Disordered Proteins

Autoren: Hamidreza Ghafouri, Pavel Kadeřávek, Ana M Melo, Maria Cristina Aspromonte, Pau Bernadó, Juan Cortes, Zsuzsanna Dosztányi, Gabor Erdos, Michael Feig, Giacomo Janson, Kresten Lindorff-Larsen, Frans A. A. Mulder, Peter Nagy, Richard Pestell, Damiano Piovesa
Veröffentlicht in: arXiv, 2025, ISSN 2331-8422
Herausgeber: Cornell University
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.03590

DisProt in 2026: enhancing intrinsically disordered proteins accessibility, deposition, and annotation

Autoren: Maria Victoria Nugnes, Kamel Eddine Adel Bouhraoua, Mehdi Zoubiri, Rita Pancsa, Erzsébet Fichó, null null, Alexander M Monzon, Ana M Melo, Edoardo Salladini, Emanuela Leonardi, Federica Quaglia, Daniyal Nasiribavil, Hamidreza Ghafouri, Gobeill Julien, Emilie Pasche, Patrick Ruch, Paul Van Rijen, László Dobson, Marco Schiavina, Trinidad Cordero, Zsófia E Kálmán, Ximena Castro, Valentín Iglesias, István Reményi, Mahta Mehdiabadi, Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi, Peter Tompa, Damiano Piovesan, Silvio C E Tosatto, Maria Cristina Aspromonte
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 54, 2026, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF1175

Selective engineering of condensation properties of single-stranded DNA binding (SSB) protein via its intrinsically disordered linker region

Autoren: Péter Ecsédi; Dávid Érfalvy; Zoltán J Kovács; Viktoria Katran; János Pálinkás; Miklós Cervenak; Rita Pancsa; Gábor M Harami; László Smeller; Mihály Kovács
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2025, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAF481

Fine‐tuned interactions between globular and disordered regions of single‐stranded <scp>DNA</scp> binding (<scp>SSB</scp>) protein are required for dynamic condensation under physiological conditions

Autoren: Zoltán J. Kovács; Péter Ecsédi; Gábor M. Harami; János Pálinkás; Mina Botros; Lamiya Mahmudova; Viktoria Katran; Dávid Érfalvy; Miklós Cervenak; László Smeller; Mihály Kovács
Veröffentlicht in: Protein Science, 2025, ISSN 1613-6829
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/PRO.70109

<scp>DR</scp> and <scp>SPIT</scp>: Statistical approaches for identifying transient structure in intrinsically disordered proteins via <scp>NMR</scp> chemical shifts

Autoren: Dániel Kovács; Andrea Bodor
Veröffentlicht in: Protein Science, 2025, ISSN 1469-896X
Herausgeber: Wiley-Blackwel
DOI: 10.1002/PRO.70250

MOBIDB in 2025: integrating ensemble properties and function annotations for intrinsically disordered proteins

Autoren: Damiano Piovesan; Alessio Del Conte; Mahta Mehdiabadi; Maria Cristina Aspromonte; Matthias Blum; Giulio Tesei; Sören von Bülow; Kresten Lindorff-Larsen; Silvio C E Tosatto
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/NAR/GKAE969

Phase transition drives bacterial single-stranded DNA binding (SSB) protein mobilization during stress response and metabolic adaptation

Autoren: Péter Ecsédi1 , Júlia Szittyai1 , János Pálinkás1,2, Bálint Jezsó1,2, Viktoria Katran1 , Zoltán J. Kovács1,2, Henriett Halász3 , Tasvilla Sonallya4 , Tünde Juhász4 , Tamás Beke-Somfai4 , Szilvia Barkó3 , Edina Szabó-Meleg3 , and Mihály Kovács1,2
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.28.672810V1

DRMAAtic: dramatically improve your cluster potential

Autoren: Del Conte, Alessio; Ghafouri, Hamidreza; Clementel, Damiano; Mičetić, Ivan; Piovesan, Damiano; Tosatto, Silvio C E; Monzon, Alexander Miguel
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances, 2024, ISSN 2635-0041
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOADV/VBAF112

GeomeTRe: accurate calculation of geometrical descriptors of tandem repeat proteins

Autoren: Osmanli, Zarifa; Ferrero, Elisa; Monzon, Alexander Miguel; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF395

Deep learning for intrinsically disordered proteins: From improved predictions to deciphering conformational ensembles

Autoren: Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 89, 2024, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102950

Critical Assessment of Protein Intrinsic Disorder Round 3 ‐ Predicting Disorder in the Era of Protein Language Models

Autoren: Mahta Mehdiabadi, Alessio Del Conte, Maria Victoria Nugnes, Maria Cristina Aspromonte, Silvio C. E. Tosatto, Damiano Piovesan
Veröffentlicht in: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/PROT.70045