Projektbeschreibung
Mehrskalige Modellierung zur Verhinderung von abweichenden Phasenübergängen bei RNA
Die Zellstruktur ist wesentlich für die Funktion, wobei viele Kompartimente durch Flüssig-Flüssig-Phasentrennung dynamische Zusammenschlüsse bilden, die als Kondensate bekannt sind. Wenn diese Kondensate fehlreguliert werden, kann es zu schädlichen Aggregaten kommen, die mit altersbedingten und neurodegenerativen Erkrankungen in Verbindung gebracht werden. Im ERC-finanzierten Projekt In-phase wird ein rechnerischer Ansatz entwickelt, um zu untersuchen, wie sich Moleküle innerhalb funktioneller Kondensate verhalten, die in pathologische feste Aggregate übergehen könnten. Durch die Integration von grobkörnigen Kraftfeldern mit atomistischen Simulationen in eine mehrskalige Modellierungsplattform sollen die Kräfte bestimmt werden, die Kondensate aus ihren funktionalen Zuständen treiben, und Strategien entwickelt werden, um abnormale Phasenübergänge von RNA und Proteinen zu verhindern.
Ziel
The spatiotemporal organization of the cell material represents one of the great wonders in physics, chemistry and biology. Compartmentalization plays a key role in such precise molecular coordination and enables cellular function. Over the past decade, transformative experiments have revealed that most intracellular compartments are not enclosed by membranes, but instead they are dynamical assemblies, termed condensates, and thought to occur via liquid-liquid phase separation of biomolecules. Nevertheless, the misregulation of these condensatesmostly formed by proteins and nucleic acidscan give rise to deleterious solid-like aggregates, which are associated with the proliferation of age-related and neurodegenerative disorders.
In-phase aims to develop an innovative computational approach to resolve the dynamical behaviour of molecules inside functional condensates that drift their complex physicochemical behaviour into pathological solid aggregates. To this end, we plan to develop a multiscale modelling platformcombining coarse-grained force fields and atomistic simulationswhich will address the following critical questions: What are the encoded molecular features in RNA and protein sequences regulating phase behaviour? What pushes biomolecular condensates to shift their material properties over time? Can we prevent the proliferation of pathological aggregates induced by condensate misregulation? The overarching goals of this project are: (1) to understand the thermodynamic and intermolecular forces driving condensates out-of-function; and (2) devise potential strategies for preventing RNA/protein aberrant phase transitions in biomolecular condensates. This alone is ground-breaking because it will reveal the underlying mechanisms and interactions by which the structure and sequence of RNA and proteins dictate the material properties of intracellular condensates, and their implication in cellular dysfunction.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
28040 MADRID
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.