Descrizione del progetto
Modellazione multiscala per prevenire le transizioni di fase aberranti dell’RNA
L’organizzazione cellulare è essenziale per la funzione, con molti compartimenti che formano assemblaggi dinamici noti come condensati attraverso la separazione di fase liquido-liquido. Se mal regolati, questi condensati possono dare origine ad aggregati dannosi associati a disturbi legati all’età e alla neurodegenerazione. Il progetto In-phase, finanziato dal CER, svilupperà un approccio computazionale per studiare il comportamento delle molecole all’interno di condensati funzionali che possono trasformarsi in aggregati solidi patologici. Integrando campi di forza a grana grossa e simulazioni atomistiche in una piattaforma di modellazione multiscala, il progetto intende scoprire le forze che spingono i condensati fuori dai loro stati funzionali e sviluppare strategie per prevenire transizioni di fase aberranti di RNA e proteine.
Obiettivo
The spatiotemporal organization of the cell material represents one of the great wonders in physics, chemistry and biology. Compartmentalization plays a key role in such precise molecular coordination and enables cellular function. Over the past decade, transformative experiments have revealed that most intracellular compartments are not enclosed by membranes, but instead they are dynamical assemblies, termed condensates, and thought to occur via liquid-liquid phase separation of biomolecules. Nevertheless, the misregulation of these condensatesmostly formed by proteins and nucleic acidscan give rise to deleterious solid-like aggregates, which are associated with the proliferation of age-related and neurodegenerative disorders.
In-phase aims to develop an innovative computational approach to resolve the dynamical behaviour of molecules inside functional condensates that drift their complex physicochemical behaviour into pathological solid aggregates. To this end, we plan to develop a multiscale modelling platformcombining coarse-grained force fields and atomistic simulationswhich will address the following critical questions: What are the encoded molecular features in RNA and protein sequences regulating phase behaviour? What pushes biomolecular condensates to shift their material properties over time? Can we prevent the proliferation of pathological aggregates induced by condensate misregulation? The overarching goals of this project are: (1) to understand the thermodynamic and intermolecular forces driving condensates out-of-function; and (2) devise potential strategies for preventing RNA/protein aberrant phase transitions in biomolecular condensates. This alone is ground-breaking because it will reveal the underlying mechanisms and interactions by which the structure and sequence of RNA and proteins dictate the material properties of intracellular condensates, and their implication in cellular dysfunction.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
28040 MADRID
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.