Descripción del proyecto
Comprender la inestabilidad cromosómica en el cáncer
La inestabilidad cromosómica (IC) es un factor clave en el desarrollo del cáncer, su progresión y la resistencia a los tratamientos. La IC se asocia a cambios en el número y la estructura de los cromosomas causados por errores durante la división celular, daños en el ADN y otros factores como el estrés oxidativo. En unas investigaciones recientes se sugiere que la IC también afecta al modo en que las células cancerosas interactúan con el sistema inmunitario, pero los mecanismos exactos siguen sin estar claros. El equipo del proyecto CINbyFUNseq, financiado por el CEI, pretende descubrir estos mecanismos mediante la creación de métodos altamente sensibles para rastrear la IC a nivel unicelular. Utilizando tecnologías avanzadas de secuenciación y elaboración de perfiles espaciales, los investigadores cartografiarán dónde y cómo se produce la IC dentro de las células e identificarán las vías moleculares implicadas. Los resultados del proyecto profundizarán nuestra comprensión de la IC y su papel en la inmunología tumoral.
Objetivo
Chromosomal instability (CIN) is a main cause of tumor heterogeneity, tumor evolution and therapy resistance of cancers. Chromosomally instable gastric cancer (CIN-gastric cancer) accounts for 50-70% of gastric tumors and is the poorest prognosis tumor subtype with the most suppressed tumor immune microenvironment. However, it is not understood how CIN contributes to poor prognosis and edits the tumor immune response of CIN-gastric cancer, due to a lack of assays investigating native CIN-driving mechanisms at the single cell level.
I invented a pioneering, microscopy-based functional single cell sequencing method, which enables selective profiling of rare subpopulations of cells displaying dynamic phenotypes of interest. In this proposal, I will use my expertise to develop novel advanced single cell and multiplexed sequencing methods and create a new research line with the aim of dissecting the driving mechanisms of CIN in CIN-gastric cancer, investigating the impact of CIN on tumor microenvironment, and elucidating the molecular pathways leading to the poor prognosis of CIN-gastric cancer. To fulfill this aim, I defined three research objectives:
In Objective I, I will develop a deep learning-based functional single cell sequencing (deepFUNseq) method to identify and profile rare, naturally occurring CIN-mother and -daughter cells derived from CIN-gastric cancer patients.
In Objective II, I will develop a multiplexed functional & spatial single cell sequencing method(multi-FUNseq) to transcriptomically profile (non-)CIN gastric cancer cells and their interacting immune cells.
In Objective III, I will investigate CIN-driving mechanisms and CIN-associated consequences in CIN-gastric cancer, including the role of CIN in immunoediting.
The technologies developed in this proposal will result in a leap in our understanding of CIN in the context of cancer, and will lead to advances in fields where profiling cell-cell interactions is important, like tumor immunology.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud medicina básica inmunología
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias médicas y de la salud biotecnología médica tecnologías celulares
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
3015 GD Rotterdam
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.