Descrizione del progetto
Approfondimenti sull’instabilità cromosomica nel cancro
L’instabilità cromosomica (chromosomal instability, CIN) è un fattore chiave dello sviluppo, della progressione e della resistenza alla terapia del cancro. La CIN è associata ad alterazioni del numero e della struttura dei cromosomi causate da errori durante la divisione cellulare, danni al DNA e altri fattori come lo stress ossidativo. Recenti ricerche suggeriscono che la CIN influisce anche sul modo in cui le cellule tumorali interagiscono con il sistema immunitario, ma i meccanismi esatti rimangono poco chiari. Il progetto CINbyFUNseq, finanziato dal CER, mira a scoprire questi meccanismi creando metodi altamente sensibili per tracciare la CIN a livello di singola cellula. Utilizzando tecnologie avanzate di sequenziamento e profilazione spaziale, i ricercatori mapperanno dove e come avviene la CIN all’interno delle cellule e identificheranno le vie molecolari coinvolte. I risultati del progetto approfondiranno la nostra comprensione della CIN e del suo ruolo nell’immunologia dei tumori.
Obiettivo
Chromosomal instability (CIN) is a main cause of tumor heterogeneity, tumor evolution and therapy resistance of cancers. Chromosomally instable gastric cancer (CIN-gastric cancer) accounts for 50-70% of gastric tumors and is the poorest prognosis tumor subtype with the most suppressed tumor immune microenvironment. However, it is not understood how CIN contributes to poor prognosis and edits the tumor immune response of CIN-gastric cancer, due to a lack of assays investigating native CIN-driving mechanisms at the single cell level.
I invented a pioneering, microscopy-based functional single cell sequencing method, which enables selective profiling of rare subpopulations of cells displaying dynamic phenotypes of interest. In this proposal, I will use my expertise to develop novel advanced single cell and multiplexed sequencing methods and create a new research line with the aim of dissecting the driving mechanisms of CIN in CIN-gastric cancer, investigating the impact of CIN on tumor microenvironment, and elucidating the molecular pathways leading to the poor prognosis of CIN-gastric cancer. To fulfill this aim, I defined three research objectives:
In Objective I, I will develop a deep learning-based functional single cell sequencing (deepFUNseq) method to identify and profile rare, naturally occurring CIN-mother and -daughter cells derived from CIN-gastric cancer patients.
In Objective II, I will develop a multiplexed functional & spatial single cell sequencing method(multi-FUNseq) to transcriptomically profile (non-)CIN gastric cancer cells and their interacting immune cells.
In Objective III, I will investigate CIN-driving mechanisms and CIN-associated consequences in CIN-gastric cancer, including the role of CIN in immunoediting.
The technologies developed in this proposal will result in a leap in our understanding of CIN in the context of cancer, and will lead to advances in fields where profiling cell-cell interactions is important, like tumor immunology.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze mediche e della salute medicina di base immunologia
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze mediche e della salute biotecnologia medica tecnologie cellulari
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
3015 GD Rotterdam
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.