Opis projektu
Badanie niestabilności chromosomalnej w raku
Niestabilność chromosomalna (CIN) jest jednym z kluczowych czynników rozwoju, progresji i oporności na leczenie nowotworów. CIN wiąże się ze zmianami w liczbie i strukturze chromosomów wywołanymi błędami podczas podziału komórek, uszkodzeniem DNA i innymi czynnikami, takimi jak stres oksydacyjny. Najnowsze badania sugerują, że CIN wpływa także na interakcję komórek nowotworowych z układem odpornościowym, ale dokładne mechanizmy tego procesu pozostają niejasne. Finansowany przez ERBN projekt CINbyFUNseq przewiduje poznanie tych mechanizmów poprzez stworzenie wysoce czułych metod śledzenia CIN na poziomie pojedynczej komórki. Korzystając z zaawansowanych technologii sekwencjonowania i profilowania przestrzennego, naukowcy przyjrzą się, gdzie i jak CIN zachodzi w komórkach oraz identyfikować zaangażowane szlaki molekularne. Wyniki tych prac pozwolą lepiej zrozumieć CIN i jej rolę w immunologii nowotworów.
Cel
Chromosomal instability (CIN) is a main cause of tumor heterogeneity, tumor evolution and therapy resistance of cancers. Chromosomally instable gastric cancer (CIN-gastric cancer) accounts for 50-70% of gastric tumors and is the poorest prognosis tumor subtype with the most suppressed tumor immune microenvironment. However, it is not understood how CIN contributes to poor prognosis and edits the tumor immune response of CIN-gastric cancer, due to a lack of assays investigating native CIN-driving mechanisms at the single cell level.
I invented a pioneering, microscopy-based functional single cell sequencing method, which enables selective profiling of rare subpopulations of cells displaying dynamic phenotypes of interest. In this proposal, I will use my expertise to develop novel advanced single cell and multiplexed sequencing methods and create a new research line with the aim of dissecting the driving mechanisms of CIN in CIN-gastric cancer, investigating the impact of CIN on tumor microenvironment, and elucidating the molecular pathways leading to the poor prognosis of CIN-gastric cancer. To fulfill this aim, I defined three research objectives:
In Objective I, I will develop a deep learning-based functional single cell sequencing (deepFUNseq) method to identify and profile rare, naturally occurring CIN-mother and -daughter cells derived from CIN-gastric cancer patients.
In Objective II, I will develop a multiplexed functional & spatial single cell sequencing method(multi-FUNseq) to transcriptomically profile (non-)CIN gastric cancer cells and their interacting immune cells.
In Objective III, I will investigate CIN-driving mechanisms and CIN-associated consequences in CIN-gastric cancer, including the role of CIN in immunoediting.
The technologies developed in this proposal will result in a leap in our understanding of CIN in the context of cancer, and will lead to advances in fields where profiling cell-cell interactions is important, like tumor immunology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna immunologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna technologie komórkowe
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
3015 GD Rotterdam
Niderlandy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.