Descrizione del progetto
Il modo in cui le cellule scelgono quali RNA conservare
Sebbene le cellule producano costantemente grandi quantità di RNA, la maggior parte di esso viene distrutta. Ogni gene genera molecole di RNA essenziali, congiuntamente a molti frammenti corti e instabili: in tal modo si crea una combinazione eterogenea all'interno del nucleo. Come fanno le cellule a sapere quali RNA conservare e quali scartare? Il progetto NuRS, finanziato dal CER, si propone di approfondire tale questione studiando la proteina ARS2, che è fondamentale per guidare gli RNA verso la stabilità o la degradazione. Mappando il modo in cui ARS2 interagisce con altre proteine e fattori di trascrizione, i ricercatori si prefiggono di scoprire le regole che determinano il destino dell'RNA, un processo la cui comprensione chiarirà le modalità con cui le cellule gestiscono un'ampia produzione genomica, proteggendo al contempo i messaggi essenziali dell'RNA.
Obiettivo
Mammalian genomes are hyperactively transcribed and, paradoxically, a major part of the produced RNA is turned over soon after its synthesis. But the situation is even more bizarre. This is because individual transcription units (TUs), that generate standard functional transcripts, also give rise to a flock of shorter labile isoforms. Overall, this presents an extraordinarily chaotic situation where the expression of functional RNA, both at the genomic- and at the single TU-level, is embedded within a sea of futile transcription products. Being predominantly transcribed by RNA polymerase II, labile RNAs share common features with their functional counterparts, which motivates the basic question of the NuRS proposal: Which molecular mechanisms dictate the sorting of nuclear RNAs into stable, functional ribonucleoprotein particles vs. those destined for degradation?
The major challenge of mechanistically rationalizing RNA sorting has for long been without concrete and testable hypotheses. However, recent breakthroughs by us, and others, have found that the essential ARS2 protein holds binary functions in RNA maturation and degradation. Given its cap-proximal omnipresence on nascent RNA, we hypothesize that transcript fate is governed by the competitive interaction of ARS2 with productive and destructive factors. Through a delineation of the responsible protein complexes and domains, we will dissect the underlying molecular logic, both at steady state and in the dynamic context of stem cell differentiation. This includes exploring our provocative finding that the domain of ARS2, interacting with RNA processing and degradation factors, can also interact with transcription factors. How these transcriptional and post-transcriptional links impinge on RNA sorting will be uncovered, which will disclose the fundamental question of how cells cope with a massive genomic output without erroneously degrading functional RNA or leaving spurious transcripts ignored.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
8000 Aarhus C
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.