Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Nuclear RNA Sorting

Opis projektu

W jaki sposób komórki wybierają, które RNA zatrzymać

Komórki stale produkują duże ilości RNA, ale większość z niego ulega zniszczeniu. Każdy gen generuje niezbędne cząsteczki RNA, a także wiele krótkich, niestabilnych fragmentów. Tworzy to dezorientującą mieszankę wewnątrz jądra. Skąd komórki wiedzą, które RNA zachować, a które odrzucić? Finansowany przez ERBN projekt NuRS przyjrzy się tej kwestii poprzez badanie białka ARS2. Wspomniane białko ma kluczowe znaczenie dla kierowania RNA ku stabilności lub ku degradacji. Poprzez mapowanie interakcji ARS2 z innymi białkami i czynnikami transkrypcyjnymi, naukowcy starają się odkryć reguły decydujące o losie RNA. Zrozumienie tego procesu pozwoli na wyjaśnienie, w jaki sposób komórki radzą sobie z dużą ilością danych genomowych, jednocześnie chroniąc istotne informacje zawarte w RNA.

Cel

Mammalian genomes are hyperactively transcribed and, paradoxically, a major part of the produced RNA is turned over soon after its synthesis. But the situation is even more bizarre. This is because individual transcription units (TUs), that generate standard functional transcripts, also give rise to a flock of shorter labile isoforms. Overall, this presents an extraordinarily chaotic situation where the expression of functional RNA, both at the genomic- and at the single TU-level, is embedded within a sea of futile transcription products. Being predominantly transcribed by RNA polymerase II, labile RNAs share common features with their functional counterparts, which motivates the basic question of the NuRS proposal: Which molecular mechanisms dictate the sorting of nuclear RNAs into stable, functional ribonucleoprotein particles vs. those destined for degradation?

The major challenge of mechanistically rationalizing RNA sorting has for long been without concrete and testable hypotheses. However, recent breakthroughs by us, and others, have found that the essential ARS2 protein holds binary functions in RNA maturation and degradation. Given its cap-proximal omnipresence on nascent RNA, we hypothesize that transcript fate is governed by the competitive interaction of ARS2 with productive and destructive factors. Through a delineation of the responsible protein complexes and domains, we will dissect the underlying molecular logic, both at steady state and in the dynamic context of stem cell differentiation. This includes exploring our provocative finding that the domain of ARS2, interacting with RNA processing and degradation factors, can also interact with transcription factors. How these transcriptional and post-transcriptional links impinge on RNA sorting will be uncovered, which will disclose the fundamental question of how cells cope with a massive genomic output without erroneously degrading functional RNA or leaving spurious transcripts ignored.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-ADG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

AARHUS UNIVERSITET
Wkład UE netto
€ 2 499 988,00
Koszt całkowity
Brak danych

Beneficjenci (1)