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Elucidating in-situ small molecule-RNA interactions by proximal reverse transcription-based sequencing

Projektbeschreibung

Kartierung von RNS-gerichteten Arzneimitteln

Das RNS-Spleißen ist ein wichtiger Schritt bei der Genexpression, bei dem nicht-kodierende Sequenzen (Introns) aus der prä-mRNA entfernt werden, bevor die Proteinsynthese stattfinden kann. RNS-Spleißdefekte liegen vielen genetischen Erkrankungen zugrunde, und die Beeinflussung dieses Signalwegs gewinnt als therapeutische Strategie zunehmend an Interesse. Es bleibt jedoch eine große Herausforderung zu verstehen, wie kleine Moleküle selektiv RNS oder RNS-bindende Proteine (RBP) binden. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen geförderte Projekt SMART-RT zielt darauf ab, eine neuartige Methode zur Kartierung der Wechselwirkungen kleiner Moleküle mit RNS und RBP in Zellen zu entwickeln. Dies wird wichtige Erkenntnisse über die RNS-Biologie liefern und dürfte die Entdeckung von RNS-gerichteten Medikamenten für verschiedene genetische Erkrankungen beschleunigen.

Ziel

RNA is vital for cellular processes that include transcription, translation, and gene expression, making it an attractive drug target. However, deciphering the selective interaction between small molecules and RNA remains challenging due to RNA's dynamic structure and limited chemical functionality. Although FDA-approved drugs like Evrysdi have demonstrated the therapeutic potential of RNA binding small molecules, precise and reliable methods for targeting the interactions remain underdeveloped. This project aims to develop a Small Molecule-Assisted RNA Targeting and Reverse Transcription (SMART-RT) method to address this important challenge. The primary objective of SMART-RT is to create an in-situ interaction map of small molecules that interact with RNA or RNA-associated proteins (RBPs) in live cells. This innovative method will use RNA/RBP-binding small molecules to induce proximal reverse transcription (RT), enabling precise and sensitive mapping of RNA sequences and their interactions in their native cellular environment through downstream sequencing. By overcoming the limitations of current methods, SMART-RT will offer a detailed map of RNA/RBP interactions with small molecules, providing new insights and opportunities for the targeting of RNA biology and facilitating the discovery of novel therapeutics. This multidisciplinary project combines chemical biology, molecular biology, and medicinal chemistry to map RNA/RBP-small molecule interactions, using cutting-edge biotechnology for scientific exploration. It leverages my expertise in biochemistry and medicinal chemistry, providing extensive RNA technology training and fostering interdisciplinary collaborations. Aligned with MSCA’s goals of promoting innovation and knowledge transfer, the project will advance scientific discovery and technological development. Awarded MSCA Fellow will boost my research independence and equip me as group leader in biotechnology, enabling significant contributions to the field.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 276 187,92
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Vereinigtes Königreich

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Region
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0