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Elucidating in-situ small molecule-RNA interactions by proximal reverse transcription-based sequencing

Descrizione del progetto

Mappatura dei farmaci mirati all’RNA

Lo splicing dell’RNA è una fase centrale dell’espressione genica, in cui le sequenze non codificanti (introni) vengono rimosse da pre-mRNA prima che possa avvenire la sintesi proteica. I difetti di splicing dell’RNA sono alla base di molte malattie genetiche e intervenire su questa via sta destando estremo interesse come strategia terapeutica. Tuttavia, comprendere come le piccole molecole si leghino selettivamente all’RNA o alle proteine leganti l’RNA (RBP) rimane una sfida importante. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto SMART-RT si propone di sviluppare un metodo innovativo per mappare le interazioni di piccole molecole con RNA e RBP nelle cellule. Ciò fornirà importanti informazioni sulla biologia dell’RNA e dovrebbe accelerare la scoperta di farmaci mirati all’RNA per varie condizioni genetiche.

Obiettivo

RNA is vital for cellular processes that include transcription, translation, and gene expression, making it an attractive drug target. However, deciphering the selective interaction between small molecules and RNA remains challenging due to RNA's dynamic structure and limited chemical functionality. Although FDA-approved drugs like Evrysdi have demonstrated the therapeutic potential of RNA binding small molecules, precise and reliable methods for targeting the interactions remain underdeveloped. This project aims to develop a Small Molecule-Assisted RNA Targeting and Reverse Transcription (SMART-RT) method to address this important challenge. The primary objective of SMART-RT is to create an in-situ interaction map of small molecules that interact with RNA or RNA-associated proteins (RBPs) in live cells. This innovative method will use RNA/RBP-binding small molecules to induce proximal reverse transcription (RT), enabling precise and sensitive mapping of RNA sequences and their interactions in their native cellular environment through downstream sequencing. By overcoming the limitations of current methods, SMART-RT will offer a detailed map of RNA/RBP interactions with small molecules, providing new insights and opportunities for the targeting of RNA biology and facilitating the discovery of novel therapeutics. This multidisciplinary project combines chemical biology, molecular biology, and medicinal chemistry to map RNA/RBP-small molecule interactions, using cutting-edge biotechnology for scientific exploration. It leverages my expertise in biochemistry and medicinal chemistry, providing extensive RNA technology training and fostering interdisciplinary collaborations. Aligned with MSCA’s goals of promoting innovation and knowledge transfer, the project will advance scientific discovery and technological development. Awarded MSCA Fellow will boost my research independence and equip me as group leader in biotechnology, enabling significant contributions to the field.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 276 187,92
Indirizzo
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito

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Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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