Descrizione del progetto
Un approfondimento sulla biogenesi della parete cellulare batterica
I batteri Gram-negativi sono definiti da una membrana esterna che protegge la cellula e media le interazioni con l’ambiente e l’organismo ospitante; essa si basa su proteine e lipoproteine specializzate, che devono essere ripiegate con precisione da macchinari cellulari endogeni. Mentre questi processi sono ben compresi nell’Escherichia coli, le conoscenze in merito agli altri principali gruppi batterici sono molto ridotte. Il progetto BactOMPbuild, finanziato dal CER, si concentra sui batteri del phylum Bacteroidota, che comprendono abbondanti commensali dell’intestino umano, importanti patogeni e specie diffuse nell’ambiente. La ricerca svelerà il modo in cui i Bacteroidota assemblano la loro membrana esterna e come trasportano le lipoproteine di superficie, rivelando inoltre i principi fondamentali e rilevanti dal punto di vista medico della biogenesi dell’involucro cellulare batterico.
Obiettivo
Gram-negative bacteria are distinguished by the presence of an outer membrane (OM) at the cell periphery. This membrane is the site at which the bacterium interacts with its environment (or host if a pathogen), and provides the first line of defence against antibiotics, mechanical stresses, and immunological attacks. These functions depend on the presence of proteins that either span the outer membrane (Outer Membrane Proteins, or OMPs) or are anchored to the membrane by a lipid tail (lipoproteins). Sophisticated machinery is required to target, insert, and fold these proteins. Although this machinery is well-characterised in Escherichia coli and related organisms, it remains unclear how OM proteins are assembled in other major Gram-negative phyla.
In this project we aim to elucidate novel features of OM protein biogenesis in bacteria of the phylum Bacteroidota (formerly Bacteroidetes). The Bacteriodota are key human commensals, but also include major anaerobic pathogens, and are environmentally abundant. The pathways for OM protein biogenesis in the Bacteroidota differ from the E. coli paradigm in at least two major ways that we will investigate.
First, we have discovered that the Bam complex that is responsible for inserting OMPs into the OM has a very different composition from the E. coli paradigm and includes novel extracellular subunits. We now seek to identify the function(s) of these additional subunits and elucidate their molecular mechanism.
Second, in contrast to E. coli, the cell surface of Bacteroidota bacteria is coated with abundant lipoproteins (surface lipoproteins, or SLPs) that must be exported across the OM by a currently unknown mechanism. We aim to identify and characterise this SLP transporter as well as the novel pathway that our work has shown is needed for delivering SLPs to the OM.
To carry out these tasks we will employ in vivo and in vitro protein biochemistry, bacterial genetics, and structural analysis by cryoEM.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia farmaci antibiotici
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
OX1 2JD Oxford
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.