Opis projektu
Wgląd w biogenezę ściany komórkowej bakterii
Bakterie Gram-ujemne są zdefiniowane przez błonę zewnętrzną, która chroni komórkę i pośredniczy w interakcjach ze środowiskiem i gospodarzem. Błona ta zależy od wyspecjalizowanych białek i lipoprotein, które muszą być precyzyjnie składane przez endogenną maszynerię komórkową. Chociaż procesy te są dobrze poznane w Escherichia coli, niewiele wiadomo o tym, jak działają one w innych głównych grupach bakterii. Finansowany przez ERBN projekt BactOMPbuild skupia się na bakteriach z rodzaju Bacteroidota, które obejmują liczne komensalne bakterie jelitowe człowieka, ważne patogeny i gatunki rozpowszechnione w środowisku. Badania pozwolą odkryć, w jaki sposób Bacteroidota budują swoją błonę zewnętrzną oraz jak transportują lipoproteiny powierzchniowe. Projekt ujawni fundamentalne i istotne z medycznego punktu widzenia zasady biogenezy otoczki komórkowej bakterii.
Cel
Gram-negative bacteria are distinguished by the presence of an outer membrane (OM) at the cell periphery. This membrane is the site at which the bacterium interacts with its environment (or host if a pathogen), and provides the first line of defence against antibiotics, mechanical stresses, and immunological attacks. These functions depend on the presence of proteins that either span the outer membrane (Outer Membrane Proteins, or OMPs) or are anchored to the membrane by a lipid tail (lipoproteins). Sophisticated machinery is required to target, insert, and fold these proteins. Although this machinery is well-characterised in Escherichia coli and related organisms, it remains unclear how OM proteins are assembled in other major Gram-negative phyla.
In this project we aim to elucidate novel features of OM protein biogenesis in bacteria of the phylum Bacteroidota (formerly Bacteroidetes). The Bacteriodota are key human commensals, but also include major anaerobic pathogens, and are environmentally abundant. The pathways for OM protein biogenesis in the Bacteroidota differ from the E. coli paradigm in at least two major ways that we will investigate.
First, we have discovered that the Bam complex that is responsible for inserting OMPs into the OM has a very different composition from the E. coli paradigm and includes novel extracellular subunits. We now seek to identify the function(s) of these additional subunits and elucidate their molecular mechanism.
Second, in contrast to E. coli, the cell surface of Bacteroidota bacteria is coated with abundant lipoproteins (surface lipoproteins, or SLPs) that must be exported across the OM by a currently unknown mechanism. We aim to identify and characterise this SLP transporter as well as the novel pathway that our work has shown is needed for delivering SLPs to the OM.
To carry out these tasks we will employ in vivo and in vitro protein biochemistry, bacterial genetics, and structural analysis by cryoEM.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja lek antybiotyki
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-ADG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.