Projektbeschreibung
Verknüpfung der Wachstumsdynamik mit der Produktion sekundärer Metabolite in Bodenbakterien
Bakterielle Sekundärmetaboliten (SM) sind wertvolle antimikrobielle Wirkstoffe. Allerdings schreiten Entdeckungen aufgrund der raschen Resistenzentwicklung und des begrenzten Verständnisses der Produktionszeitpunkte verschiedener Bakterien nur langsam voran. Das über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützte Projekt GROWMETA wird aufdecken, wie die Dynamik der SM-Produktion in natürlichen und Laborumgebungen mit Wachstumsraten und transkriptomischen Veränderungen bei Bodenbakterien zusammenhängt. Es wird ein Zeitreihen-Wiedervernässungsexperiment an einer Biokruste der Negev-Wüste durchgeführt, die als Modell für eine verringerte Bodenvielfalt dient. Das Projekt wird zu verschiedenen Zeitpunkten quantitative Stabilisotopen-Untersuchungen, Metagenomik und Metatranskriptomik verwenden, um spezifische Wachstumsraten und Expressionsprofile für aus Metagenomen zusammengesetzte Genome zu bestimmen. Die Ergebnisse sollen die Entdeckungspipelines in diesem Bereich verbessern.
Ziel
Bacterial secondary metabolites are highly valuable to humanity as antimicrobials. However, the antimicrobial discovery rate has been lagging behind rapid resistance development. Our lack of knowledge about when and why different taxa produce secondary metabolites is a major source of difficulty in the discovery process. Studies on Actinomycetes in batch culture have shown that secondary metabolites tend to be produced in stationary phase, but evidence suggests that production dynamics are different in other phyla as well as in situ. The goal of this project is to understand how in situ and in vitro SM production dynamics relate to growth rate and transcriptomic changes in soil bacteria. To achieve this, I will conduct a time-series rewetting experiment on a Negev desert biocrust as a model system of soil with reduced diversity. I will apply quantitative stable isotope probing metagenomics and metatranscriptomics to each timepoint to obtain a specific growth rate and expression profile for each metagenome-assembled genome. I will supplement the in situ data with in vitro expression studies in isolates. Together, this will allow me to assess how growth rate & phase, expression of other pathways, and the soil environment impact secondary metabolite biosynthetic gene cluster expression. The results of this project will give unprecedented insights into the dynamics of secondary metabolite production, challenge long-held assumptions, and ultimately lead to improved discovery pipelines.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1010 Wien
Österreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.