Opis projektu
Badanie zależności dynamiki wzrostu z produkcją metabolitów wtórnych u bakterii glebowych
Metabolity wtórne bakterii są cennymi środkami przeciwdrobnoustrojowymi. Ich odkrywanie jest jednak czasochłonne ze względu na szybką oporność i ograniczoną wiedzę na temat czasu produkcji różnych bakterii. Dzięki wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt GROWMETA pozwoli na zbadanie, w jaki sposób dynamika produkcji metabolitów wtórnych w warunkach naturalnych i laboratoryjnych jest powiązana z szybkością wzrostu i zmianami transkryptomowymi u bakterii glebowych. Prace obejmą przeprowadzenie eksperymentu ponownego nawadniania w czasie na bioskorupie pustyni Negew, która posłuży jako model zmniejszonej różnorodności glebowej. Zespół wykorzysta ilościowe sondowanie izotopów stabilnych, metagenomikę i metatranskryptomikę w różnych punktach czasowych w celu określenia specyficznych szybkości wzrostu i profili ekspresji dla genomów uzyskanych w wyniku metagenomu. Wyniki tych prac powinny przyczynić się do ulepszenia procesów badań terenowych.
Cel
Bacterial secondary metabolites are highly valuable to humanity as antimicrobials. However, the antimicrobial discovery rate has been lagging behind rapid resistance development. Our lack of knowledge about when and why different taxa produce secondary metabolites is a major source of difficulty in the discovery process. Studies on Actinomycetes in batch culture have shown that secondary metabolites tend to be produced in stationary phase, but evidence suggests that production dynamics are different in other phyla as well as in situ. The goal of this project is to understand how in situ and in vitro SM production dynamics relate to growth rate and transcriptomic changes in soil bacteria. To achieve this, I will conduct a time-series rewetting experiment on a Negev desert biocrust as a model system of soil with reduced diversity. I will apply quantitative stable isotope probing metagenomics and metatranscriptomics to each timepoint to obtain a specific growth rate and expression profile for each metagenome-assembled genome. I will supplement the in situ data with in vitro expression studies in isolates. Together, this will allow me to assess how growth rate & phase, expression of other pathways, and the soil environment impact secondary metabolite biosynthetic gene cluster expression. The results of this project will give unprecedented insights into the dynamics of secondary metabolite production, challenge long-held assumptions, and ultimately lead to improved discovery pipelines.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
1010 Wien
Austria
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.