Projektbeschreibung
„Spezialisierte“ Ribosomen und Zellschicksal
Ribosomen sind makromolekulare Strukturen, die aus RNA und Protein bestehen und die Proteinsynthese katalysieren. Einst galt die Annahme, dass sie einheitlich seien, heute ist bekannt, dass sie eine strukturelle und funktionelle Vielfalt einschließlich RNA-Modifikationen aufweisen. Dies stellt bisherige Theorien in Frage und deutet an, dass es sich bei bestimmten Ribosomen um spezialisierte Ribosomen handelt, die bei Prozessen wie der Zelldifferenzierung selektiv bestimmte Boten-RNA übersetzen können. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts NANORIBS beabsichtigt, die Rolle von RNA-Modifikationen bei der Ribosomenspezialisierung zu untersuchen. Dazu werden die Forschenden ein neuartiges Nanoporen-basiertes Verfahren anwenden, bei dem wichtige Ribosomenmerkmale beibehalten werden und gleichzeitig eine Einzelmolekülauflösung erzielt wird. Die Studie wird sich darauf konzentrieren, wie ribosomale Modifikationen Entscheidungen über das Schicksal von Neuronen beeinflussen und damit wichtige Erkenntnisse über die Neurodegeneration liefern.
Ziel
Ribosomes, once considered uniform molecular entities, are now recognized for their compositional heterogeneity, challenging traditional views on their role in gene expression. This has led to the hypothesis of 'specialised' ribosomes that selectively translate specific mRNA subsets, though the extent of this specialisation, particularly in cell fate determination, remains debated. Recent findings suggest that rRNA modifications, such as 2’-O methylation, may drive ribosomal specialisation during cellular differentiation. However, how these modifications translate into specialised functions is still poorly understood. Current methods like ribosome profiling (RiboSeq) offer limited resolution, particularly at the isoform level and in untranslated regions (UTRs), limiting our ability to fully elucidate ribosome specialisation.
To address this, I propose NANORIBS, a novel nanopore-based ribosome profiling technique that achieves single-molecule resolution of ribosome footprints on full-length mRNAs. This method leverages long-read sequencing to preserve critical information such as poly-A tail length and UTR sequences, essential for understanding ribosome-mRNA interactions. NANORIBS will investigate the role of specific rRNA methylations, particularly the 18S:355Um modification, in neuronal cell fate commitment.
By offering unprecedented insights into the molecular mechanisms governing ribosome-mediated translation regulation during differentiation, NANORIBS could revolutionise our understanding of gene expression control at the translational level. Deciphering the functional consequences of rRNA modifications could lead to new therapeutic targets and strategies for diseases linked to aberrant cell differentiation, such as cancer and neurodegenerative disorders. NANORIBS not only advances ribosome biology but also paves the way for future research into the broader implications of ribosomal specialisation in health and disease.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
08003 Barcelona
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.